Basic Information

Symbol
NRP2
RNA class
mRNA
Alias
Neuropilin 2 VEGF165R2 Vascular Endothelial Cell Growth Factor 165 Receptor 2 Neuropilin-2 Receptor For VEGF165 And Semaphorins Class3 Neuropilin-2a(17) Neuropilin-2a(22) Neuropilin-2b(0) PRO2714 NPN2 NP2
Location (GRCh38)
2:205681990-205798133
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003872.3
Sequence length
6644.0 nt
GC content
0.5045

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2273.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2389.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1293.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_003872.3 NCBI
AGAGAUCGCGAGCGAGGCACCAGCCUGCAGCCGGCCCCCAGCACAUCCU… 6644 nt 0.5045
NM_018534.4 NCBI
AGAGAUCGCGAGCGAGGCACCAGCCUGCAGCCGGCCCCCAGCACAUCCU… 6699 nt 0.5001
NM_201264.2 NCBI
AGAGAUCGCGAGCGAGGCACCAGCCUGCAGCCGGCCCCCAGCACAUCCU… 2577 nt 0.5448
NM_201266.2 NCBI
AGAGAUCGCGAGCGAGGCACCAGCCUGCAGCCGGCCCCCAGCACAUCCU… 6659 nt 0.5040
NM_201267.2 NCBI
AGAGAUCGCGAGCGAGGCACCAGCCUGCAGCCGGCCCCCAGCACAUCCU… 6684 nt 0.5006
NM_201279.2 NCBI
AGAGAUCGCGAGCGAGGCACCAGCCUGCAGCCGGCCCCCAGCACAUCCU… 6593 nt 0.5055
Summary

This gene encodes a member of the neuropilin family of receptor proteins. The encoded transmembrane protein binds to SEMA3C protein {sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3C} and SEMA3F protein {sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3F}, and interacts with vascular endothelial growth factor (VEGF). This protein may play a role in cardiovascular development, axon guidance, and tumorigenesis. This protein has also been determined to act as a co-receptor for SARS-CoV-2 (which causes COVID-19) to infect host cells. [provided by RefSeq, Jul 2021]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the NRP2 is a marker for venous endothelial cells, identifying a specific venous endothelial cluster within interscapular brown adipose tissue [Behrens et al. DOI:10.1016/j.molmet.2025.102252]. In human dermal lymphatic endothelial cells, the NRP2 is expressed as a lymphatic-specific marker [Ducoli et al. DOI:10.1038/s41467-021-21217-0].