Basic Information

Symbol
NSD1
RNA class
mRNA
Alias
Nuclear Receptor Binding SET Domain Protein 1 ARA267 KMT3B Histone-Lysine N-Methyltransferase, H3 Lysine-36 Specific Nuclear Receptor-Binding SET Domain-Containing Protein 1 Androgen Receptor-Associated Protein Of 267 KDa Androgen Receptor Coactivator 267 KDa Protein NR-Binding SET Domain-Containing Protein Lysine N-Methyltransferase 3B H3-K36-HMTase FLJ22263 STO Histone-Lysine N-Methyltransferase, H3 Lysine-36 And H4 Lysine-20 Specific Nuclear Receptor SET Domain-Containing Protein 1 Androgen Receptor-Associated Coregulator 267 Sotos Syndrome H4-K20-HMTase EC 2.1.1.357 EC 2.1.1.43 SOTOS1 SOTOS
Location (GRCh38)
5:177131787-177300213
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022455.5
Sequence length
13042.0 nt
GC content
0.4748

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4190.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4438.66 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3151.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((((((....((((......))))....)))))))).))))...(((((..((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((..(((((((((......)).))))..(((((((((.((....))...))))))))).)))((((.((((....)))))))).((((((..((((((((.(......))))........)))))..((((((((((..(((((((((....((((((((((((..((.((((((((((.((((...(((.....)))......))))((((((...(((((((.((((((((((...))))))..)))).))).))))(((((((.(((((((((((.....)))))))).)))(((.....)))..(((((.(((((((...))).))))..))))))))))))....((((((..(((.((((....))))..))))))))).......((.((((((((((..((((((.....))))))..))..)))))))))))))))).....(((....))).....((((((....)))))).........((((.....))))((((((((..............((.((((((((((..((((.(((((((.((.(.((((.....)))).).))))))))).))).)....))))).))))).))..((((..(((((((((((((((((((((((((....))))..(((.(((((((.(((.(((.(((((........((((((((.((((..(((((.((((.(((((....((((((...((((.(.((.((((.(((((.........((((((((((......((((......(((.....)))......................((((.((((((((((((((.(((.(((((((((((((((((.....(((((((.((..................(((........))).......((((((((((.(((..........)))(((((((((((((((....(((((((..........(((.(((((.(.(((..(((((((..((.......(((((.((.......)).))))).....))..)))))))))).).))))).)))....(((((..............))))).((((((((((((((...((((((...(((((.........((.((((....)))).))((((....))))((((...(.((........)).)((((((((..(((....)))..))))))))))))(((((((((((((.((((..((..(((((((.....................((((....))))((((((((((..............((((((((((...((((..((((((....)))))).....(((((((.((.....(((((((....(((.(((((((......((((((.....((.(((..((((.((.(((((((((.........(((((((((.(...((((((((((((.(((((.....(((((((.((((.....))))............(((((((((..(((...(((((((..((((.(.(........).).))))..)))))))((((((((.(((..((((........)))).)))..(((.....))).))))))))......((..((.......))..))......(((((((....(((..(((.(((....))).)))..)))....)))))))(((((((..(((..((..(....)..))..)))...))))))))))..)))))))))...)))))))......)))(((((((((...........))))))).))...........((((.......)))))).)))))))))))).))))))))))(((((...((.((((((((((....))))))((((((....).)))))..))))))...))))).((((((((((((......((((((((((((((((((((((((((.(((((((..((...))..)))).))).)))))))...(((((.((...(((..((.((...(((((......((.((((.(.((((...))))...).)))).))......))))).(((((((((((((....((((.((.((((((...((......))...)))))).)).)))).(((((((((((......(((.((((...(((((...(((.((((.(((......((((...((((..(((.....)))..))))....)))).(((((.....(((((((....))).)))).....)))))...))))))).)))....))))).....)))).)))....((((((.....(((((...........................))))).....))))))((((.........))))..)))))))))))....))))......))).)))))).)).)))))...)).))))).....(((....)))........))))).)))))))))..............((.(((((.(((((.......))))).))))).)).(((((((....))))))).............(((.(((((((((.(((((.....(((((((.....(((((((..(((..(...)..)))..))).)))).......)))))))................(((((.....)))))...............(((...((((((((.....)))..)))))...)))......)))))))))))))))))..)))))......)))))))))))).))))))))))).))))..))).))...((((((((((((((....))))).)))..)))))).......((((((((.....)).))))))...(((.((.((((....)))).)).)))....(((((((((.....)))))))))((.(((((((((..((........)).)))))))))))..................((((..((((............)))).)))).(((((....))))))))))))))))))))))))))))..))))))))).)))).))))).))))).............))))).))))).......((((((((.(.((((((....))))))..).))))))))....)))))))..))....))))..)))))))))))))..)))))...))))))(((((((((.....(((((.......))).)).........(((...)))..((((.((.....((((..(((......)))..))))......)).))))))))))))).(((((((((((((.(((.(((.....(((((((....(((((.((((((((((((........))).))))..)))))..)))))..(((.........)))(((...((....))...))).......((((((..((((((...)))))).....)))))).(((((((((((((...((((.....))))((((.........)))).((((....)))).((((((((.....(((((..(((((((...(((((((((((((((.....((((......))))..........((((........)))).)))))))))))((((((..(((....)))))))))((((((((..(((.((((.(((......(((((.....(((((.((........)).)))))......(((((((((......))))..(((((((.((.(((((((..(((((........))))).....((((((((((....)))).)).))))...(((((..((....))(((((((......))))))).))))).....))))))).(((.((......))..)))((((((((((((......)))))((((.......)))).((((((......))))))..))))))).....((((((..(((((..(((.(..((((((((((((((((((.((((.((((........)))))))).(..((((((((((((((((........((((((((.(((..(((((((........)))))))..((((((((((((((((((((...(((((....)))))...)))))...)))...))))).)))))))((((.(.(((.(..((((((((.(((...)))...).))))))).))))).))))(((((((((((((((((((((((..((((((.((..........(((((...((((....))))..((((((..........(((((....)))))..........))).)))))))).....(.(((......))).)(((((((...........((((((......))).)))...((((.((((((((.......))))))))..))))..(((((..((((((((((.....)))))))))).)))))...)))))))..((.............))((((((((.......))))))))..............(((((...)))))..)).))))))))))))).)))).........((((((((.((((((..(..((((.....((((..((......(((((((..(.(..(((((.(...(((((............))))).....).))).)).))..)))))))......))..)))).(((......)))......))))..)..)))))).)))))))).))).))))))))))))))))))))))))))..))))))))))..).........)))..))))))))........))).))))..)..))).))))).)))))))).)))))))((((((.............(((((.((((((((((.(((((.........)))))..))).).))..)))))))))..))))))((((((((((...((((...........)))).....))))))))))))))))))))))).)))).))).....)))))))).........))))...)))))))..))))).......)))..)))))((.((.....)).)))))))).)))))))...)))))))........))).))).)))))))....))))))...)))..))))))))))).........)))))))))))))..)))))))))......((((.....((....(((((..((.(((((...(((.(((((.(((((((..((.(((((..((.....(((((.((((((.((.....((((.((((..((.((....)))).))))...))))..)).)))))).(((((((((.......)))))))))..((((((((((((((((((.((((((.((((((((((((..(((((..((((.....))))...(((...)))((((((((((((.(((.((((((((..((((.......(((((.(.(((((.........(((..(((((.....))))).))))))))).))))).......)))))))))))).))))))))...........))))))).)))))..))))).....)))))))......)))......))).))....))))))..((....))................))))))))))..............((....)).(((...(((((((((........(((((((((..............((((((((.((.(((...((....(((...((((.(((((((....((((..(..(((.((......)).)))..)..)))).....))))))).(((((((.....)))))))...........((((((....))))))...........))))...)))....))))))).))))))))((((((((((((.....((((((...........(((((.((((((((((((((((.((((((((.((((((...........(((.(((........))).)))(((......)))...........)))))).))))))))........(((((.(((...)))..)))))((...))....))))))).)))))))))))))).((.(((.((((((((((...)))))....(((.((((..(((((.((...((.(((((((((((((((...)))....))))).)))).))).)).)).)))))..))))))).........)))))..)))..)).)))))).....)))))).)))))).))))))))).(((((.(((.....))).)))))...))))..))))).)))......)))))))..))))).))))))))).))))).)))))))).))..)))))....))......)))))))))))))))).)))))))...))))..)))))...((.((((((..(((.(((...(((((((.......(((.((.((((((.((((.((..((((((..((.....))..))..(((((....)))))....)))))).)))))))))))))))...)))))))..)))))))))))).))....(((.(((....))).)))...)))))))).)))))))))))((((....((((((((.(..(((.(((.....))).)))......).)))).))))..))))((..((((((...(((....)))...))))))..))...))))))))))..((((.(......).)))).))))......)))))))))).......))))).....)))).......((((((((((.......((((((((((.((((((.......(((((((((((((..((((((((((((.(((....(((.(((....)))..(.(((((((((..((((....))))..))...(((((...))))).((((((((.((((.....))))......(((((((......))))))).(((.(..(((((.....)))))..).))).)).))))))..............((((((((((((((((............((((((..((((((((.....)))...)))))))))))..))))).((...((((((....(((....)))....))))))...)).....))))))))))).....))))))).).(((((..............)))))...(((((((.......)))))))........)))....)))...))))).)))))))..))).))))((((((...))))))..........(((((..(((.......))).(((((((.(.((((((.(((........))))).))))..).))))))).....))))).........))))))..((((((((.(((...............))))))))))).))))))((((.((((...(((((((.((........))))))))))))).))))..((((((.((((......))))...)))))).((((((((.(((((.(((.....((....))...)))))))).))))).)))...))).))))))).....))))))........)))))).)))))...))))))...)))))..)))))))))....(((..(((((((.(((((..(((((((((....((((((.........)).))))))))).))))..)))))))))))).)))((((((((((((((((....(((....(((((......)))))...((...(((((((((((((((....(((.(((((((.(.(((.((((((((.((((...)))).....((((.(((....)))))))(((((((((..........((((((...(((((((...(((...((((...(((((((.((((......)))).((((....))))...(((((((((..((..((((((.(((((((((.(((((.((......)))))))...)))).))))))))(((..(((((........)))))..)))....(((((..............)))))....)))..))..)))))))))(((((((((((............(((((.....(((........)))........)))))(((((((......))))))).(((((((...........)))))))................))))).....))))))..............))))).))...))))..))).....))).))))..)))))))))))))))..(((((((.....)))))))(((((....((((((((..........(((((.((((........)))).))))).........))))).)))...))))).........))))))))))).).)))))..(((((...))))))).)))...)))))..(((...((((...((.....))...)))).))).......((((......)))).((.(((...))).))((((.....((((.((((((..((((((((.....((((.((...............)))))).....))))))))))))))))))...))))...((((.((((((((...)).)))))).))))..))))))))))....))....)))....)))))))))))))))).)))).)).))))))......(((((....((((((....))).)))...)))))...))))).))).))))))).))))))(((.((((((......)))))).))).)))))))))))))).((((((.(....)))))))..((((((..((((.((((((((.(((((.(((((((..(((...((...(((...((((((...((((.......))))((((((..(((((.(((((((((((((((((((((((((.(((((.....(((((.((((((((((.........)))).)))))).)))))......)))))...........))))))).((((..((((..........................))))..))))......))))))).(((((((((..((((((.(((((((((..((..((..(((((((((((.((...((((((((.(((((...)))..((((((.....)))))).........(((((((.....))))))))).)))))))).))(((...))).......(((((((......))))))).(((((..(((......))).))))).(((((....((((...)))).)))))....))).))))))))..))..))....))).))))))...))))))((((............)))))))))))))(((((((((.....(((((.(((..(((....)))....))).)))))........)))))))))..)))))))...((((((.(((....)))...))))))....)))).))))).))))))......(((((......)))))...))))))...))).))..))))))).))).))))))))))..))))))).)))))).................)))))))..))))......((((((((.(((((((.......((((((.......))))))....((((.((........)).))))...............(((((......))))).......))))))).))))))))))))))))...((((..((((((((((..(.(((((.........))))).)..)))))).)))))))).))))))))))))..)))))))))..))).......))))))).)).((((...((((((((((((......(((((...(((((((((((.(.(((((((((((((((........(((((((......))))))).......))))))))......((((.(((((.(((...(((((((...)))))))....))).))))).)))).....((((((((...((((......))))..((((((...(((((.(((....))))))))...))))))..((((((.(.((((((.((((((((((((....)))))......))).)))))))))).).)).))))...(((((.((((((.....(((((........))))).)))))).)))))..((((.(((..((.((((....)))).))..))).))))((((........))))..(((((((....)))))))..)))))))))))))))).)))))))))))..)))))..................((((((((((............))))))))))...(((((((((..((((.....))))..))).))))))......))))))...))))))...))))))))))))))......((((((((((((((((((((((((((((...(((((((((((((((((.((((((((.(.(((((((..((.((.((((......)))).)).)).))))))).).)).))))))..))))))).))))....(((.(((......))).)))..))))))))))))))).((((((((....((...((.((.((((((((.....))))))))..)).))..)))))).))))))))))))).))))))))))))))))..........(((((((((....((....))...))))))))))))))...)))))))))))))).(((((((((.(((((((((((.......(((((((....((((..((((((...))))))............((((((........))))))))))..)))))))..))))....))))))))))))...)))).....((((((........)).))))...(((((((((...(((((..((..(((((((......(((((..(((((...........((((.....((((((((((...........))))))..)))).....))))..((((....(((((((..((..(((....(((((((....((((((......(((((.......))))).....))))))...)))....)))).....)))..))..)))))))....))))))))).)))))....((((((......))))))......(((((((.((((((((........(((((((((((...................((((((((((((((((.((((((....(((.((((((.(.((((...(((..((((.((((((((((.(((((.(((((((.((.((((((..(.((((((..((((...(((.(((......))).)))))))..)))...........(((((.....((((((.....))))))....)))))...(((((((((((..(((......(((((((((((....)).))).....))))))..........(((((((...((((((...((((....)))).....))))))...))))))).....((((.(((.....))).))))((((.((((....)))).)))))))..)))))))))))..)))).)))))))).)))))))..((((((....))))))....))))).(((((((((((.((((((...(((((((...((((((((.(((..(((..((((.((...))..))))..)))..)))...(((((...((((((((((.....)).)))))))))))))....(((......)))..((.(((((((.((((........)))).))))))).))..)))))))))))))))))).)))))....))))))))))))))))))).)))).....)))....)))).).)))))))))...)))))).))))).(((((((..((...((((((.(((((((((((((((((((.........((..((((((((((............((..(((((((((....(((((....)))))..)))))))))..))(((((((.(.((((.......))))).)))))))((((((((...((..((((((.....))))))..))....))...)))))).))))))))))..))((((((((..((((((((.(((...))).))))))))........((((((((((((.......(((((...(((((....((((((.(((((..............))))).))))))....))))).......))))).....))))))....))))))...(((.........)))))))))))..((((...(((((((((.((.....)).))))).))))...)))))))).))((((((((((.((........)).))))))..))))...)))))))))))))))))))....))..)).)))))(((..((((((...))))))..))).))))))).)))))))))))))))))))))))))))))).....((((......)))).))))))).))..)))))...)))))))))((((((((............)))))))).....)))))))((.(((((......))))).))........))))))))))))))).))))))))............(((.(((..(((...)))..))))))......(((((..((((...))))..)))))......((((((...........))))))..........((((((....))))))))))..)))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,((((((({....((((......)))).,,},))))))),||||.......||}||,.((((((((.(((((((((((((({(((((((((((((((((((((.(((({,.(((((((((......)).))))..(((((((((.((....))...))))))))).))}((((.((((....)))))))).(({(((.{((,,,,,,}|,.}},.}}||........}))))..((((((((({..{((((((((..,,(({(((((((((..{.{((((((((((,((((.,,(((.....))}......}}}|{{,,,,...{((((((.((((((((((...))))))..)))).))),))}}{((((({.{{{((((((((.....)))))))).},|(((.....)))..(((((.(((((((...))).))))..)))))})))))}....((((((..{((.((((....))))..}}})))))).......{(.((((((((((..((((({.....})))))..))..))))))))}|(((((((....(((....))).....((((((....)))))).....,,..((((.....))))....|||......))))))),.((.((((((((((,.{(((.((((((((((.(,((({....,)))).}.))))))))).))).)....))))).))))).))..((((..(((((((((((((((((((((((((....)))}..((,{(((((((.(((.(((.(((((....(((.,,,{||{|.{{{,.,(((((.((((.(((((....((((((...((((.(.{{.((((.(((((.,.......((((((((((...,,.((((.,,...(((.....)))......................((((.(((((({(((((((((((.(((((((({{{(({{(({,...{{{{{{{{{({{................(((........))).......((((((((((.(((...,,,....|}}(((((((((((((((...,(((((((,,.......|(((.(((((.(.(((,.{((((((..((....,..,((((.{{.......}),))})},....))..)))))))))).).))))).))},,..(((((..............))))).(((((((((((,((,,,,{{{{{,}}||(({,.........,.((({....))}}.||((((....))))||{{,..{|{{.......,}},}((((((((..(((....)))..)))))))),,|.(((((((((((((.((((.{((..(((((((.,...,{........},,,..((((....))))((((((((((..............((((((((((...((((..((((((....)))))).....(((((({{((.....(((((((....(((.(((((((......((((((,....{{.(((..((((.{,{(((((((((.........(((((((({,(...{(((((((((((.({{({.....(((((((.((((.....)))).,..........(((((((((..(((.(((((((((.,{((({..,......}}))).))))}.,,,,|||{{((({{,.{((..((((,.....,.)))).)}}..(((.....))).}}|||||..,,,,{{,..,,..,..,,}...}},}....,{,|,...{,{{{{,.,,,.(((((((({.....{,......},.,.)))))))}},....|||{...,,)))))}}|,...,,..,,,)))))))..)))))))))...)))))))......))}(((((((((...........))))))).))........,,.{{{{.......)))))).)))))))))))}.))))))))))(((((...((.(((({(((((....)))))}((((((....),,))))..))))))...))))).((((((((((((......((((((((((((((((((((((((((.(((((((..((...))..)))).))).)))))))...{((((.({...{((..((.{{,..(((({...,,.{{.{(((.|.((((...}))}...,.)))}.},||....}}}||,((((((({{.,{(.,(((({...,.((((((...((......))...)))))).,|,|||{,(((((({{{{{.||,,|,||,||||...,{{{{...{{{.((((,({,,,,{,.{(((...{(((,.((,.....})),})))),,..)))},|{{(({{{{,{(({{{{..,,})),))))....,))))).}}))))))),)))....}}})),,...))}}.})),}},|||{{,...,{(((((,{{,,.,,.........,..|,..,,.,}},,.....))))}}||||}},......))}})}))}))))}}))..||}}}.,|,,.,|||}|,}||,....))}},..,)}.))))).....(((....)))........))))),}))))))))...,.,,.......{(,(((((.(((((.......))))).))))).}}.(((((((....)))))))....|,|,,....|||,|((((((({{(((((.....(((((((.....(((((((..(((..(...}..)))..))).)))).......)))))))..,,...,,,,,...,{{{{{.,,,{|,|||,,,...}}|}}}}}.{{{,,,((((((((.....))),.}))))...)))......)))))))))))))},,...)))))......)))))))))))).))))))))))}.))))..))).}}.,.((((({{(,((((,....,,,,,}))).})))))).,,....(({{((((,....}),)))))}...{((.((.((((....}))).)).))).,|,(((((((((.....)))))))))((.(((((((((..({........},.)))))))))}).,,,.....,,,},....((((..((((............)))).)))).,((({...,))))))))))))))))))))))))))))..))))))))).)))).))))).))))).............))))).))))).......((((((((.{.((((((....))))))..}.))))))))....)))))))..))....))))..))))))))))))),.,}}||{,,||,,},(((((((((.,...(({((.......|||{||,...,....(({...}}}.,||{{.{|,},.}||||,,{||,...,.)))}|},,,,},...,}.))),))))))))).{{{{(((((((((.(((,(({.....{||||||..,.(((((.((((((((((((........))).))))..)))))..))))).|{{{.....{{{.{({{((,...,..||}}|},||},,,....{(((((..((((({...}))))).....)))))}.(((((((((((((.,,((({.....}}||,|{{..{{{{..,{{{,.{(((|,..,|||.((((((((.....(((((..(((((((...{((({((((((((((.....((((......}))}..........((((........)))).))))))))))}((((((..(((....))))))))){((((((((({((.((((,,{{{|,,..,{{,,..,,|||||||.||{{{|||,}}}}}||..{||||{{,.{{{{{...|||,.})}}|))}}},,,,))))|))),}},|||,...}}}}))))),...,|||{||{||{,,,,||||.,,.||||..{(,((({(((..,,{,,..((((((..((({||(((.{.{{...},.}))))))))..)))))}...},....,||,.{(((((((......)))))))||}..{{({{{{{.{{{{{{......}}}}||((((((......................))))))}|{|(({{{((((.,.((({,{(({.{,{|.||,..|})))}}})),|,.|{((,{(({.|{(({,......,}||||||||},,,..(((((((........)))))))((((((((..({....|}..)))))))),.....|||||{{|{||||{{{{||{{{{|,,||,|{{{({((((,..{{{,{,,({{{|{{|,{|{..,))),,.)}))}}))),||||{{|||,(((((((((((((((((((((((..((((((.((..........(((((...,{{{....|,,....||..,,...........,{,....})}|(((((,...}}}}},,..))))).,},.,.(((.....,))}.,(((((((,{{{,,.....|{((({.....,})).}}).,,||||.((((((((.......))))))))..}}},..(((((..((((((((((.....)))))))))).)))))...)))))))..{{.....,,.,...}}}((((((((.......))))))))..............{((({...))))}..)).)))))))))))))})))).........((((((((.((((((..,..(((({{,,.((((..((......{((((((..{.{..{{{((.,...(((((............))))).....),})),}}.}}..)))))))......}}..)))).|{{......}},....})))))..).,)))))).)))))))).))).)))))))))},}}}},,},))))}})).}}}}))))))}},..}))))).))...{{{{{{,....,}}}}}...((((.((((.({...,,(((((((((((...{{{.{(((((.............(((({,(((((({(((.,((((,,....,}.)))),..))).),},..)))))))))..))))))})))))))))))).})).)))).)))).))))))}..)))))))}.)))),...)))|)}..))))))),}}}})))))))}....,,,,.)))}...)))))))..))))).....,.)))},}))))||}||,,,.,})}}})))))).)))))))...))))))),,,.},},,}).))}.)))))))},.,).))}}}}}}}}..))))))))))),...,....)))))))))))))..)))))))))....,,{(|(|{{{{(.....,}}||}}|(,(((((...((,.(((((.(((((((..((.(((((..((.....{{({{.((((((.((.....((((.((((..((.((....)))).))))...))))..)).)))))).{{{,((((({(....,|||||||,|..((((((((((((((((((.,,,....{{|||,|||||,..(((((.,((((............,,,})))))||||,({(((({,(((.((((((((..((({.,.....(((((.(.(((((...(({{..,{{..{({,,....,)))))},,.)))))).))))).....,.))),)))))))).))))))))...........|,|||||.||,||{{|||||....{|||,||.......,,)}},,,..,.}))..}.)))))}}.||,,,,}}................)))))))))){{{,....,,,,.,((.....,.,||,..,(((((((({{{.....,{,,,,(((,....}},}....,,,,,{((({...,||,..||..,.|,|,,,,,,..(((((((....((((..{..(((.((......)).)))..,..)))).....))))))),)}}}}}}}}}(((((((((((.......)))))))}})),..,)))}}}}}}}}})},}}}....,|,{{{||...,,.||}}}|||((((((((((((.....((((((.........,{{((({{((((((((((((((((,((((((((.((((((...........(((.(((........))).))){{{......}}}..,,.......)))))).))))))))........(((((.(((...)))..))))){{...}}...,}))))))},))))))))))))}.}}.{((,{(({,(((((...})))),...{{{|||||.,{((.,....}}||{{||{||{{,|||{{{...}}}.||,|,,.}}}})),}|{,|..,..,)))}..,,,,.||,,,,..,}}}))))..}))..,,.)))))).....)))))}.))))},.}}}}}|||{,,{{{({(((.....}}}.,}}},...))))}.}))))}}},,,....}))}}))..))))).))})))))).))))).,))))))).}},,,}}|||...,)}}...}),})))))))))))))}))))))},},)))),.|||||...((.((((((..((,{(((...(((((((,,.....{((.((.((((((.((((.((..((((((..((.....}}..}|..{{{{,....)))}),,..)))))).))))))))))))}))}..)))))))..)))))))))))).)).,,,|||,||{....))).}))...)))))))).))))))))))|((((....((((((((,{,,(((.(({.....))).))),,....)})))),,)))..)))),.((((((((...(((....}}).}.)))))))))....))))))))))..((((.{......}.)))).)))),,....)))))))))),,.....))))).....)))).......((((((((((.,.....((((((((((.(({(({,......(((((((((((((..((((((((((((..{(....((({{,{....|,,,.{.((((((({(..((((....))))..})...(((((...))))).((((((((.((((.....))))...,{,(((((((..,,,.))))}}}.{||.{..(((((.....)))))..).))}.))}))))))..............((((((((((({((((...|,,......((((((..((((((((.....)))...)))))))))))..))}}}.,{...((((((....(((....)))....))))))...)),....))))))))))).....))))))).}.(((((..{.,....,,,..)))))...(((((((.......)))))))........,,}..}}))).,,))))).)))))))..))).)))){(((({...}}}}|}.......,..{(({,..,,......,.},{.(((((((.{.((((({.(((........)))}}.))))..}.))))))).,...,,}}}.........))))))..{{((((((.((({{,...,}}......})))))))))).)))))}((((.((({..,(((((({,((........))))))))))))).))))..((((((,((((......)))).,.)))))).{(((((((.(((((.(((.....({...,}}...)))))))).))))),)},...))).)))))))....,))))))........))))}},,))))...))))))...)))))..))))))))).,,,{((,,(((((((.(((((..(((((((((,...((((((.........))}})))))))).))))..)))))))))))).}|}(({{({((((((({{(,,..((,....(((((......)))))...|,.,.||||{|||||}}.(({.,,,,{}||{((((,(.((,,((((((({..,{{,{,,|||,....((({{(((....)))))))..,{,{|||,,,,..,,,|{{(((,..,{{((((({,{(((({{{((((({(((({...((((......)))).((((....))))...(((((((((..((..((((,,.(((((((((.(((((.((......)))))))...)))).)))))})}|||,,{{{{({..,.{{{}}}}},,),.....{((((..............))))}...})))..))..))))))))),((((((((({..,......,,.{{,({.....,,..{{,..,.}}}........}}||}(({{{||},,...}}}||||,((((((,.......,,,,)))))))................})))).....)))))},||||,{{,,..........,,......,...{{,{{,,{{|||||}|,..,,}||||}}}||||{{,{{(((..{,{,||||{{,..{{,,,..,||||||..........(((((.{(((........)))).)))))}))),}})))}.}||||},,.}))}}........,))))})))))).}.)}}}}.,(((((...)))))}(({((({(({{|,..((,...(((({({{....,.,,...}}}}.}}}.,..}},||||,...,,||}}.(({(((...,))}))|{((.....((({{((((({..((((((((.....(((({(({{....}}}}}}.,,),,))).....))))))))))))))))))...))))...((((.((((((((...)),}))))).)))),})))}))))))}...,,.,},))}.}},)))))))))))}))))})))}.}),)}}}}}},..,.{((((....((((((....)))}}))...))))).}}))))).))).))))))).))))))(((.((((((......)))))).))).)))))))))))))).((((({,(....)))))))..((((((..((((.(({(((((.(((((.(((,{(({{(((...((...(((...((((((...{(((.......}}}|((((((,,(((((.{(((((((({,((((((((((((((.(((((.....(((((.((((((((((.........)))).)))))).)))))......)))))...........})))))),{(({..((((..........................})))..}}}}.....|})))))},{(((((({{..{(((((.(((((((((..(({{(({,({,,,,{({(({,({{{((((((((.,{{{{...}}}{{((((((.....)))))),},......(((((((.....))))))))}.))))))}}.|,{{{...)))....,,.(((((((......))))))).((((({,((,..,,}}}},.))))).(((((....((((...)))).)))))..},))))))))))))}}),..},.,.,))}||}}}}}..,,)}}}}..||,},,},,,.,}}}}},}}))))))){((((((((,....(((((.(((..(((....)))....))).)))))........))))))))}.{((((((((((((......)))}}}))).))))).}}.}},)))).))})},))))},.|,|..,,|||......}}},....))))))...))).))..))})))),))).))))))))))..})))))).)))))).,,,.....,,,.....)))))))..)))).....(((((((((.(((((((.......((((((.......)))))).,{,((((.((........)).))))...}}},......,.(((((......))))).......))))))).)))))))))}}}}},....(((..,((((((((((..(.(((((......,..))))).)..)))))).}))))))).)))))))))))}..)))))))))..}}}.,,,...))))))).)},((((...((((((((((((......(((((...(((((((((((.,.(((((((((((((((........(((((((......))))))).......)))))))).....,{{{{.{{{{{.{{({{,(((((({...|||}}},....}}},))))).})))},..,((((((((.,.((((......))))..,{{{{{..,(((((,({{,...,}},}))},},)))))}..((((((.(.((((((.((((((((((((....)))))......))).)))))))))).).))}})))...(((((.((((((,{.,,({({{........)}))}.)))))).))))}..((((.(((..((.((((....)))).))..))).)))){{{{........}))}..{((((({....})))))},.)))))))))))))))}.)))))))))))..))))){((((.{{....,},.))))|{{(((((,,,{,,,,.,,.}||||}},...,,{{{|||{|{.,{{{{.,,,,))))|,||}.}}}}}},.,},,))))))...))))))...))))))))))))))......((((((((((((((((((,{((((((((...(((((({((((((((((.((((((((.,.((((((,..,,.||,|||,...,,,)))).)|,|,.}}}|})}|},}},,}}}||,.}}})))),))))....|{(|(||,,,...,))})),..))))))))))))))),((((((((...,{{...,,.{{.((((((((.....))))))))..}}.,}..,,)))).))))))))))))),))))))))))||}}}}.....,....(((((((((....({...,}....))))))))),))))...)))))))))))))).(((((((({,((((((({{(....,{,.(((((((....((((,.((((((...})))))..........,.{((({{,,....,)))))))))))..))))))).)),}}....))))))))))))...)))).....((((((........)).))))...(((((((((...(((((..,({.(((((((......((({{..{{(({|,,,,......{(((.,.,,(((,((((((...........)))))).,||}}....,}}},..{(((....(((((((..((..{{{....(((((((.,..((((((.,,...(((((.......)))))...,,))))))..,)))....)))).....})}..))..)))))))....))))))))).}))))....{({{(({{{{..,,))))}}},,.(((((((.((((((((........(((((((((((.,{,,{,,....,,}}},|((((((((((((((((.((((((....{{{.((((((.{.{{{{.,,(({..((((.((((((((((.(((((,(((((((.((.((((((.{(.{,.||{{{(((,.,,,{..,,{,{{{{,||{{,|,,}}|..||||||...,,,..(((((.,...((((((.....))))))..}.))))).,|{((({{(({{{,.{||||,,,.(((((((((({....)).))}....}))))))..........(((((((...((((((...((({....}))).....))))))...))))))).,})))}.||{{{|,||.||((((,(((((.((((....)))).))))),)})))}}),,,,))}})))}.)))))))).))))))}..((((((....)))))).}},})))).((((((((({{.((((((...(((((({..,((((((((.(((..(((..((((.{{...,),.))))..)))..)))...(((({...{((((((({{.....}}.)))))))}}}})),,,,({,......}}}..{{.{((((((.((((........)))).))))))}.}}..)))))))))))))))))).)))}}....))))))))))))))))))).)))).....}}}....)))).,.)))))}}},...)))))).))))),(((((((..((...((((((.(((((((((((((({(((({,,....{(((..((((((((((..{({...{{{{(({.,{((((({(..{{((,,.}}},|||||{{|||,,}},,}})).||||||..,,|||}.,,}))))))..))),,},(((((((,...((,.({{(((.....}.}))}.,))..,.)),.})))))).))))))))))..)))|((((((.,{(((((((.(({...|}|.})))))}}..,{,,,.(({{((((({{{.......{{{{{...(((((....((((({.(((((...........,..))))).,)))))....))))),,..,,.),))),,.,,))}})),.},}))))}..,,,...,,,,....}.))))))|{{{(,,,...,,|||||{{{(({,...,,.,}}}},))))...))}))))).},((((((((((.((........)).))))))..))))..,,))))))))))))))))))....))..)).)))))(((..((((((...))))))..))).})))))).)))}))))))))))))))))))))))))))..,..((((......)))).))))))).))..)))))...)))))))))((((((((............)))))))).....))))))){{.(((((......))))).})........})))))))))))))).))))))))...,,,,,....{{{,{{{..{{|,..,}}.,||}}}.......(((((..((({...))))..))))).....,{,{{{{.,....,,,..}}}}}},|........||||||},..||||||{|...})))))))}...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_022455.5 NCBI
GAGGCGGCGGCGGAAUAGGCCGGGGCAGGUCGCGCUCGCUGCCUUCUCC… 13042 nt 0.4748
NM_172349.5 NCBI
AUUUUGUUUCCUGCUCAGCUUGGUCUGUGGUGGUGGUGGUGGUGGUGGU… 12262 nt 0.4758
Showing 11 to 12 of 12 entries
Summary

This gene encodes a protein containing a SET domain, 2 LXXLL motifs, 3 nuclear translocation signals (NLSs), 4 plant homeodomain (PHD) finger regions, and a proline-rich region. The encoded protein enhances androgen receptor (AR) transactivation, and this enhancement can be increased further in the presence of other androgen receptor associated coregulators. This protein may act as a nucleus-localized, basic transcriptional factor and also as a bifunctional transcriptional regulator. Mutations of this gene have been associated with Sotos syndrome and Weaver syndrome. One version of childhood acute myeloid leukemia is the result of a cryptic translocation with the breakpoints occurring within nuclear receptor-binding Su-var, enhancer of zeste, and trithorax domain protein 1 on chromosome 5 and nucleoporin, 98-kd on chromosome 11. Multiple transcript variants encoding distinct isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2018]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.