Basic Information

Symbol
NSMCE1
RNA class
mRNA
Alias
NSE1 Component Of SMC5/6 Complex NSE1 Homolog, SMC5-SMC6 Complex Component NSE1 Non-Structural Maintenance Of Chromosomes Element 1 Homolog Non-SMC Element 1 Homolog Non-SMC Element 1 Homolog (S. Cerevisiae) EC 2.3.2.27
Location (GRCh38)
16:27224993-27268788
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_145080.4
Sequence length
1042.0 nt
GC content
0.5240

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-346.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -365.86 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 227.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_145080.4 NCBI
AAAGGAAGAAGAGUCCACCUUGCGACCGUAUCCGCUAGCGCGGCCUGGG… 1042 nt 0.5240
Summary

Enables protein dimerization activity and ubiquitin protein ligase activity. Involved in DNA damage response. Located in nucleoplasm. Part of Smc5-Smc6 complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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