Basic Information

Symbol
NSUN2
RNA class
mRNA
Alias
NOP2/Sun RNA Methyltransferase 2 TRM4 Misu SAKI RNA Cytosine C(5)-Methyltransferase NSUN2 Myc-Induced SUN-Domain-Containing Protein Myc-Induced SUN Domain-Containing Protein NOL1/NOP2/Sun Domain Family, Member 2 MRNA Cytosine C(5)-Methyltransferase TRNA Cytosine C(5)-Methyltransferase Substrate Of AIM1/Aurora Kinase B NOP2/Sun Domain Family, Member 2 TRNA Methyltransferase 4 Homolog FLJ20303 MRT5 Mental Retardation, Non-Syndromic, Autosomal Recessive, 5 TRNA Methyltransferase 4 Homolog (S. Cerevisiae) NOP2/Sun RNA Methyltransferase Family Member 2 TRNA (Cytosine(34)-C(5))-Methyltransferase TRNA (Cytosine-5-)-Methyltransferase NSUN2 NOL1/NOP2/Sun Domain Family Member 2 5-Methycytoisine Methyltransferase EC 2.1.1.203 EC 2.1.1.29 EC 2.1.1.- EC 2.1.1 HTrm4
Location (GRCh38)
5:6599237-6633304
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017755.6
Sequence length
3056.0 nt
GC content
0.4692

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-959.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1019.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1025.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001193455.2 NCBI
GUAGGGCUAGAGUUCUGGCCGUGGCGGGCCGGUUUCUGCGUGCUGCGUG… 2951 nt 0.4703
NM_017755.6 NCBI
GUAGGGCUAGAGUUCUGGCCGUGGCGGGCCGGUUUCUGCGUGCUGCGUG… 3056 nt 0.4692
Summary

This gene encodes a methyltransferase that catalyzes the methylation of cytosine to 5-methylcytosine (m5C) at position 34 of intron-containing tRNA(Leu)(CAA) precursors. This modification is necessary to stabilize the anticodon-codon pairing and correctly translate the mRNA. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been noted for this gene.[provided by RefSeq, Mar 2011]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.