Basic Information

Symbol
NT5E
RNA class
mRNA
Alias
5''-Nucleotidase Ecto 5'-Nucleotidase Ecto CALJA CD73 ENT NT5 EN IMP-Specific 5'-Nucleotidase Thymidylate 5'-Phosphatase 5'-Deoxynucleotidase Ecto-5'-Nucleotidase 5'-Nucleotidase EC 3.1.3.5 5'-NT NTE 5'-Nucleotidase, Ecto (CD73) Purine 5-Prime-Nucleotidase 5' Nucleotidase (CD73) CD73 Antigen EC 3.1.3.35 EC 3.1.3.89 EC 3.1.3.91 EC 3.1.3.99 E5NT NT
Location (GRCh38)
6:85449584-85495791
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002526.4
Sequence length
3562.0 nt
GC content
0.4248

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1000.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1069.37 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 938.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001204813.2 NCBI
ACUCGCCGGCACUCGCCCGGCUCGCCCGCUUUCGCACCCAGUUCACGCG… 3412 nt 0.4191
NM_002526.4 NCBI
ACUCGCCGGCACUCGCCCGGCUCGCCCGCUUUCGCACCCAGUUCACGCG… 3562 nt 0.4248
Summary

The protein encoded by this gene is a plasma membrane protein that catalyzes the conversion of extracellular nucleotides to membrane-permeable nucleosides. The encoded protein is used as a determinant of lymphocyte differentiation. Defects in this gene can lead to the calcification of joints and arteries. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Mar 2011] CIViC Summary for NT5E Gene

Forensic Context

A study in rats demonstrated that adipose-derived stem cells (ASCs) isolated from animals with a 60% total body surface area scald burn showed no significant changes in the protein or mRNA expression of the NT5E compared to non-burned controls, indicating its stability as a positive identification marker for ASCs following severe injury [Prasai et al. DOI:10.007/s12015-017-9721-9]. The research further found that enriched ASCs maintained their characteristic cell-surface marker profile, differentiation potential, and proliferative ability, with the NT5E expression remaining unaffected by the post-burn inflammatory environment.