Basic Information

Symbol
NTM
RNA class
mRNA
Alias
Neurotrimin IGLON2 HNT IgLON Family Member 2 CEPU-1 NTRI NT
Location (GRCh38)
11:131370478-132336822
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001352005.2
Sequence length
2936.0 nt
GC content
0.4619

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-864.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -921.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 740.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001048209.2 NCBI
AGAGUAUGAGUGGAGAUAAUUACGGAGAAGUCAUACUCUCUCACACCCU… 2903 nt 0.4616
NM_001144058.2 NCBI
GCUUUUCUCCUCCCCGCGCCUCCCGGUCGCCGCGGGUUCACCGCUCAGU… 2890 nt 0.4844
NM_001144059.3 NCBI
GCUUUUCUCCUCCCCGCGCCUCCCGGUCGCCGCGGGUUCACCGCUCAGU… 1447 nt 0.5301
NM_001352001.2 NCBI
AGAGUAUGAGUGGAGAUAAUUACGGAGAAGUCAUACUCUCUCACACCCU… 2972 nt 0.4613
NM_001352002.2 NCBI
GCUUUUCUCCUCCCCGCGCCUCCCGGUCGCCGCGGGUUCACCGCUCAGU… 2926 nt 0.4836
NM_001352003.2 NCBI
AGAGUAUGAGUGGAGAUAAUUACGGAGAAGUCAUACUCUCUCACACCCU… 2939 nt 0.4610
NM_001352004.2 NCBI
GCUUUUCUCCUCCCCGCGCCUCCCGGUCGCCGCGGGUUCACCGCUCAGU… 2893 nt 0.4836
NM_001352005.2 NCBI
AGAGUAUGAGUGGAGAUAAUUACGGAGAAGUCAUACUCUCUCACACCCU… 2936 nt 0.4619
NM_001352006.2 NCBI
AGAGUAUGAGUGGAGAUAAUUACGGAGAAGUCAUACUCUCUCACACCCU… 3056 nt 0.4604
NM_001352007.2 NCBI
AGAGUAUGAGUGGAGAUAAUUACGGAGAAGUCAUACUCUCUCACACCCU… 3023 nt 0.4601
Showing 1 to 10 of 19 entries
Summary

This gene encodes a member of the IgLON (LAMP, OBCAM, Ntm) family of immunoglobulin (Ig) domain-containing glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchored cell adhesion molecules. The encoded protein may promote neurite outgrowth and adhesion via a homophilic mechanism. This gene is closely linked to a related family member, opioid binding protein/cell adhesion molecule-like (OPCML), on chromosome 11. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2009]

Forensic Context

A study in human cardiac tissue from ischemic cardiomyopathy patients demonstrated that the NTM is upregulated in fibroblasts [Simonson et al. DOI:10.1016/j.celrep.2023.112086].