Basic Information

Symbol
NTM
RNA class
mRNA
Alias
Neurotrimin IGLON2 HNT IgLON Family Member 2 CEPU-1 NTRI NT
Location (GRCh38)
11:131370478-132336822
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001352005.2
Sequence length
2936.0 nt
GC content
0.4619

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-864.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -921.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 740.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001352008.2 NCBI
GAGCUUGGCGUCCGCGCGGCUCCGGUGCGGGCUGCGCCGCGCCUUCCCC… 3060 nt 0.5033
NM_001352009.2 NCBI
ACCCAAGUGAGCACUUUUGCAGGCCCAGCAUCUUUUAAUGGCGACAAAA… 2692 nt 0.4662
NM_001386964.1 NCBI
ACCCAAGUGAGCACUUUUGCAGGCCCAGCAUCUUUUAAUGGCGACAAAA… 2773 nt 0.4688
NM_001386965.1 NCBI
ACCCAAGUGAGCACUUUUGCAGGCCCAGCAUCUUUUAAUGGCGACAAAA… 2849 nt 0.4672
NM_001386966.1 NCBI
ACCCAAGUGAGCACUUUUGCAGGCCCAGCAUCUUUUAAUGGCGACAAAA… 3814 nt 0.4740
NM_001386967.1 NCBI
AGAGUAUGAGUGGAGAUAAUUACGGAGAAGUCAUACUCUCUCACACCCU… 3011 nt 0.4616
NM_001386968.1 NCBI
AGAGUAUGAGUGGAGAUAAUUACGGAGAAGUCAUACUCUCUCACACCCU… 2764 nt 0.4620
NM_001386969.1 NCBI
AGAGUAUGAGUGGAGAUAAUUACGGAGAAGUCAUACUCUCUCACACCCU… 4025 nt 0.4703
NM_016522.3 NCBI
GCUUUUCUCCUCCCCGCGCCUCCCGGUCGCCGCGGGUUCACCGCUCAGU… 2857 nt 0.4844
Showing 11 to 19 of 19 entries
Summary

This gene encodes a member of the IgLON (LAMP, OBCAM, Ntm) family of immunoglobulin (Ig) domain-containing glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchored cell adhesion molecules. The encoded protein may promote neurite outgrowth and adhesion via a homophilic mechanism. This gene is closely linked to a related family member, opioid binding protein/cell adhesion molecule-like (OPCML), on chromosome 11. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2009]

Forensic Context

A study in human cardiac tissue from ischemic cardiomyopathy patients demonstrated that the NTM is upregulated in fibroblasts [Simonson et al. DOI:10.1016/j.celrep.2023.112086].