Basic Information

Symbol
NTRK1
RNA class
mRNA
Alias
Neurotrophic Receptor Tyrosine Kinase 1 TRKA TRK MTC High Affinity Nerve Growth Factor Receptor Neurotrophic Tyrosine Kinase, Receptor, Type 1 TRK1-Transforming Tyrosine Kinase Protein Tropomyosin Receptor Kinase A Tropomyosin-Related Kinase A Tyrosine Kinase Receptor A EC 2.7.10.1 P140-TrkA Gp140trk Trk-A Neurotrophic Tyrosine Kinase Receptor Type 1 Tyrosine Kinase Receptor Oncogene TRK EC 2.7.10 TRK1
Location (GRCh38)
1:156815636-156881850
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002529.4
Sequence length
2669.0 nt
GC content
0.6280

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1238.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1281.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 606.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001007792.1 NCBI
GCACCCUGGUCAUCUGCGGACUCAGCCUGAGCUUCCAGAGGGCCUAGGA… 2581 nt 0.6114
NM_001012331.2 NCBI
GGAGGCCUGGCAGCUGCAGCUGGGAGCGCACAGACGGCUGCCCCGCCUG… 2651 nt 0.6277
NM_002529.4 NCBI
GGAGGCCUGGCAGCUGCAGCUGGGAGCGCACAGACGGCUGCCCCGCCUG… 2669 nt 0.6280
Summary

This gene encodes a member of the neurotrophic tyrosine kinase receptor (NTKR) family. This kinase is a membrane-bound receptor that, upon neurotrophin binding, phosphorylates itself and members of the MAPK pathway. The presence of this kinase leads to cell differentiation and may play a role in specifying sensory neuron subtypes. Mutations in this gene have been associated with congenital insensitivity to pain, anhidrosis, self-mutilating behavior, cognitive disability and cancer. Alternate transcriptional splice variants of this gene have been found, but only three have been characterized to date. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for NTRK1 Gene

Forensic Context

A study in human and rat corpus cavernosum tissue demonstrated that the NTRK1 was mentioned as an example of evolutionary divergence in sensory neurons within the introductory or discussion sections of the literature [Yin et al. DOI:10.1016/j.celrep.2024.114760].