Basic Information

Symbol
NUBPL
RNA class
mRNA
Alias
NUBP Iron-Sulfur Cluster Assembly Factor, Mitochondrial HuInd1 C14orf127 IND1 Iron-Sulfur Protein Required For NADH Dehydrogenase Iron-Sulfur Cluster Transfer Protein NUBPL Nucleotide Binding Protein Like IND1 Homolog FLJ12660 Chromosome 14 Open Reading Frame 127 Nucleotide Binding Protein-Like Nucleotide-Binding Protein-Like MC1DN21
Location (GRCh38)
14:31489956-31861226
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_025152.3
Sequence length
3040.0 nt
GC content
0.4092

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-924.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -988.90 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 602.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001201573.2 NCBI
AUAUGUUUAUCUCAUGCCAUUAGAGUGACCAUGACUUUCACAAGGUCGG… 2823 nt 0.3936
NM_001201574.2 NCBI
CUUCUAAACAACCAGAUCUUGCGUGAACUAACCGAGCGAGAACUCACUU… 2726 nt 0.3936
NM_025152.3 NCBI
AGUUUCCCAGCAGGGCUCACAGCAGCGUUCCGCGUCAUGGGGAUUUGGC… 3040 nt 0.4092
Summary

This gene encodes a member of the Mrp/NBP35 ATP-binding proteins family. The encoded protein is required for the assembly of the respiratory chain NADH dehydrogenase (complex I), an oligomeric enzymatic complex located in the inner mitochondrial membrane. Mutations in this gene cause mitochondrial complex I deficiency. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, May 2014]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.