Basic Information

Symbol
NUF2
RNA class
mRNA
Alias
NUF2 Component Of NDC80 Kinetochore Complex NUF2R CT106 CDCA1 NDC80 Kinetochore Complex Component NUF2 Cell Division Cycle-Associated Protein 1 Cell Division Cycle Associated 1 Cancer/Testis Antigen 106 Kinetochore Protein Nuf2 HNuf2R HsNuf2 HNuf2 NUF2, NDC80 Kinetochore Complex Component, Homolog (S. Cerevisiae) NUF2, NDC80 Kinetochore Complex Component, Homolog
Location (GRCh38)
1:163266576-163355766
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_145697.3
Sequence length
1964.0 nt
GC content
0.3885

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-491.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -530.10 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 567.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.((((((((...(((.....((((((.((((........(((((((.(((..(((.((((((((.((..(((...((((((.(.....).)))))).)))...(((((((.((.((((((((.(...(((.(((.(((((........((((((((((.((((..(((((......)))))))))((((((((.((((((.....)))))).))))))))...))))))))))........))).))(((((.((...(((((....(((((...)))))..)))))...)))))))................(((((((.......)))))))((((((......((...(((.(((....))))))))......))))))..)))...)))...))).....)))))).).).)))))))(((((((..(((.....))).......(((((((((((((....((((((((..(((......)))..)))))))).........((((((((....))).)))))....((((.(((..(((.(((((..(((((..(((((.((((..((((((((((..((((...(((((((...((.(((((...........)))))))...))).......))))...))))..))))))))))((((((((....(((((.......)))))..))))))))...............(((((.......((....))......)))))...)))))))))..)))))..))))))))))).)))).)))))))))))))((((.......)))).....)))))))((......)))).))))))))))))))..))))))))))).)))))).....)))...))))))....((((...)))).((((((((...(((((((((((..........((((....))))..(((((.((....(((((((...)))))))....)).)))))...........((((((.((((((((((.((((...............................(((.....((........))..))).......(((..((((((((....(((.(((.(((((((((((((((((.((..(......)..)).)).)))))).....................((((((((...................(((((((((..(((....)))....((((....))))(((((..(((.(.((((..................)))).).....(((((((((..((((((.((.(((((...(((......)))..))))))))).................(((((....))))).............((((.....((..(((((.......)))))..))........)))).)))).)))))))))...)))..)))))...(((.(((((..........))))).))).........)))))))))))))))))....))))).)))))))))).))))))))..)))....)))).))))))))))...))))))..........((((..(((((((((..((((......))))((((((........(((((((.((((..((((((...))))))...(((((........(((((........)))))...((((.(((((((((((((((((........)).)))))))))).).))))))))))))).....((((......)))))))).)))))))........)))))).(((((((.((((((((((((.((((........)))))))))))...........)))))..)))))))...)))....)))))).))))...((((.((((((..........)))))).)))))))))))))))....)))))))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((.((((((((...(((.....(((((({(,,,..}},.,.(((((((.(((..(((.((((((((.(({({{,..,((((((.(..,,,|.|||}},{{{{|{{,{{|||,|||||||.|,|,,}||{|||,((,,{,(((,...||}.{(((((((((.{(((..(((((......))))))))}((((((((.((((((.....)))))).))))))))...)))))))))|,,,,...,{{{..{((({{.{,...,||||....(((({...})))).,)))))}},}}}||||{{.....((((((((,(((((((.......)))))))....{((,...,))}(((((((((((.{{{({...,,{(({{(.{({...{{.,,.{{{{....{{({{(,{{{,,.((((.....)))).|}}||}}.|...,,),...}))}.}}.}}..))).}}}}},((((((((..(((......)))..)))))))){{{{.......)))}))).)).))))))}}))))..,))))))))..})))))..||{{{,,|||||.|{|{}}||{((((({{,,((((,,{((((({,,,,((.(((((...........))))),|,,,}||,,,.,.|}}}|...}}}}..}}}}))))}|((((((({....(((((.......)))))..))))))))}.........,{{,.(((((.......{{....)).....,)))))...,})))))})..}}}},{((((((|(({......))).))))))))..,|{||....},,)))).,))))}))))}||.}..,})))).))))))))))))))..))))))),),,.}))))).....)))...))))))....((((...)))).(((((({,...(((((((((((...{{{....{{{{....,,,,..{{(((.((.,{,{((((((...})))))),}..)).))))}.....|,....{{{(((.{(((((((((.{(((...............................{{{.....((,.......}}..,||...,,|,{{{,,((((((((....{{{.(((.((((((((({{(({(((.(({,{.,,,,.,.,||{||.}|}||,...{{....}}....,|.|,.{{|||||||||..,}|,.....,{{,||((((((((..{{|....|||.,,.((((....)))).||{||.{{{.{.{,((,{..,{.,.....,|...},}}|}.....(((((((((..(((({{,{(((((((...{{(......})).,},},,)))}}}}},............(((((....))))}..{{,.,.,....{{{{.,|..{|,.{,|||}}.....,}|||............}))),)))).)))))))))...},}..}},,}...(((.(((((..........))))).))).....,,..})))))))))))),))).|,.})))),,))))))}}}.))))))))..}}},...}))}.)))))))))|{|,||}}},.}}},},...{{((,,({(((({,{..((((......)))){{{(({,{{,{,,{(((((((.,(((..((((({...,}))))..,||{{{...,,.,,{{{{{.....,}})))},...((((.(((((((((((((((((........))))))})))))).),}))))))),}}}|.,,..{{{,.....,)))))))).))))))).......,}}}|||,((({(((.{{{{{{(({{(({((((,,......}}}})}))))).,}}}}}.,.}))))),,))))}}}...)))}}}.)))))),}))).,,((({.((((((........,.)))))).}))))))))))))))....,))))))))).))))

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_031423.4 NCBI
AGUAGGAGGCGGCAAGUUUGAAAAGUGAUGACGGUUGACGUUUGCUGAU… 1818 nt 0.3658
NM_145697.3 NCBI
AGUAGGAGGCGGCAAGUUUGAAAAGUGAUGACGGUUGACGUUUGCUGAU… 1964 nt 0.3885
Summary

This gene encodes a protein that is highly similar to yeast Nuf2, a component of a conserved protein complex associated with the centromere. Yeast Nuf2 disappears from the centromere during meiotic prophase when centromeres lose their connection to the spindle pole body, and plays a regulatory role in chromosome segregation. The encoded protein is found to be associated with centromeres of mitotic HeLa cells, which suggests that this protein is a functional homolog of yeast Nuf2. Alternatively spliced transcript variants that encode the same protein have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.