Basic Information

Symbol
NUMB
RNA class
mRNA
Alias
NUMB Endocytic Adaptor Protein C14orf41 Protein Numb Homolog H-Numb Chromosome 14 Open Reading Frame 41 Numb (Drosophila) Homolog Numb Homolog (Drosophila) Numb Homolog Protein S171 C14_5527 S171
Location (GRCh38)
14:73274146-73466167
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001005743.2
Sequence length
3604.0 nt
GC content
0.4634

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1074.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1141.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 885.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001005743.2 NCBI
ACUGGCGGCCGAGGUAGAGGCAGUGGCGCUUGAGUUGGUCGGGGGCAGC… 3604 nt 0.4634
NM_001005744.2 NCBI
ACUGGCGGCCGAGGUAGAGGCAGUGGCGCUUGAGUUGGUCGGGGGCAGC… 3460 nt 0.4598
NM_001005745.2 NCBI
ACUGGCGGCCGAGGUAGAGGCAGUGGCGCUUGAGUUGGUCGGGGGCAGC… 3427 nt 0.4608
NM_001320114.2 NCBI
ACUGGCGGCCGAGGUAGAGGCAGUGGCGCUUGAGUUGGUCGGGGGCAGC… 3480 nt 0.4655
NM_003744.6 NCBI
ACUGGCGGCCGAGGUAGAGGCAGUGGCGCUUGAGUUGGUCGGGGGCAGC… 3571 nt 0.4643
Summary

The protein encoded by this gene plays a role in the determination of cell fates during development. The encoded protein, whose degradation is induced in a proteasome-dependent manner by MDM2, is a membrane-bound protein that has been shown to associate with EPS15, LNX1, and NOTCH1. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2016]

Forensic Context

A study in mice and human samples demonstrated that phosphorylation of the NUMB by aPKC, induced via the NANOG-AURKA pathway, destabilizes its interaction with p53, leading to p53 proteolysis and promoting self-renewal of tumor-initiating stem-like cells in hepatocellular carcinoma [Machida et al. DOI:10.1016/J.Cbi.2020.109055].