Basic Information

Symbol
NUP107
RNA class
mRNA
Alias
Nucleoporin 107 Nuclear Pore Complex Protein Nup107 NUP84 Nucleoporin 107kDa 107 KDa Nucleoporin Nucleoporin Nup107 ODG6; GAMOS7 GAMOS7 NPHS11 ODG6
Location (GRCh38)
12:68686951-68745809
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_020401.4
Sequence length
6213.0 nt
GC content
0.3984

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1960.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2078.76 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1632.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001330192.2 NCBI
GAAGGGCUUGCUUCCGGAGAGCGGGAAGGCUAAAACGCGGUAGCUAAAC… 6241 nt 0.3980
NM_020401.4 NCBI
GAAGGGCUUGCUUCCGGAGAGCGGGAAGGCUAAAACGCGGUAGCUAAAC… 6213 nt 0.3984
Summary

This gene encodes a member of the nucleoporin family. The protein is localized to the nuclear rim and is an essential component of the nuclear pore complex (NPC). All molecules entering or leaving the nucleus either diffuse through or are actively transported by the NPC. Alternate transcriptional splice variants of this gene have been observed but have not been thoroughly characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.