Basic Information

Symbol
NUP133
RNA class
mRNA
Alias
Nucleoporin 133 Nuclear Pore Complex Protein Nup133 133 KDa Nucleoporin Nucleoporin 133kDa Nucleoporin Nup133 FLJ10814 Nucleoporin 133kD HNUP133 GAMOS8 NPHS18
Location (GRCh38)
1:229440259-229508356
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018230.3
Sequence length
5208.0 nt
GC content
0.4368

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1533.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1634.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1416.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_018230.3 NCBI
CUCUUCCCUUAGGUGUUUAAGUUCCGCGCGCAGGCCAGGCUGCAACCUG… 5208 nt 0.4368
Summary

The nuclear envelope creates distinct nuclear and cytoplasmic compartments in eukaryotic cells. It consists of two concentric membranes perforated by nuclear pores, large protein complexes that form aqueous channels to regulate the flow of macromolecules between the nucleus and the cytoplasm. These complexes are composed of at least 100 different polypeptide subunits, many of which belong to the nucleoporin family. The nucleoporin protein encoded by this gene displays evolutionarily conserved interactions with other nucleoporins. This protein, which localizes to both sides of the nuclear pore complex at interphase, remains associated with the complex during mitosis and is targeted at early stages to the reforming nuclear envelope. This protein also localizes to kinetochores of mitotic cells. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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