Basic Information

Symbol
NUPR1
RNA class
mRNA
Alias
Nuclear Protein 1, Transcriptional Regulator COM1 Candidate Of Metastasis 1 P8 Nuclear Protein 1 Protein P8 Nuclear Protein, Transcriptional Regulator, 1 Nuclear Transcriptional Regulator Protein 1
Location (GRCh38)
16:28532708-28539038
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012385.3
Sequence length
5291.0 nt
GC content
0.4995

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2246.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2322.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 901.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001042483.2 NCBI
GCCAGGAAAGCAGAGACAGACAAAGCGUUAGGAGAAGAAGAGAGGCAGG… 5345 nt 0.5001
NM_012385.3 NCBI
GCCAGGAAAGCAGAGACAGACAAAGCGUUAGGAGAAGAAGAGAGGCAGG… 5291 nt 0.4995
Summary

Enables DNA binding activity and transcription coactivator activity. Involved in several processes, including negative regulation of programmed cell death; positive regulation of oxidative phosphorylation; and regulation of catabolic process. Acts upstream of or within negative regulation of cell cycle. Located in intercellular bridge; nucleoplasm; and perinuclear region of cytoplasm. Part of protein-DNA complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

A study in pigs demonstrated that the NUPR1 is a target of the transcription factor HSF1 in the fat tissue of Enshi black pigs during cold exposure, and its expression decreased following HSF1 knockdown in adipose-derived stem cells under simulated cold stress [Guo et al. DOI:10.1016/j.jgg.2024.06.017]. A study in rats demonstrated that the NUPR1 was detected via immunohistochemistry, showing shrunken neurons and a decreased neuron count in the ipsilateral cortex at 48 hours following moderate fluid percussion injury, indicating neuronal loss as part of the apoptotic pathology [Shojo et al. DOI:10.1016/j.neuroscience.2010.10.018].