Basic Information
Symbol
NXF3
RNA class
mRNA
Alias
Nuclear RNA Export Factor 3
TAP-Like Protein 3
TAPL-3
TAPL3
Location (GRCh38)
X:103075810-103093143
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_022052.2
Sequence length
1956.0 nt
GC content
0.4949
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-614.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-650.68 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
580.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GUAAGCAAGGCUUGAGGCUUGCUCUCGCCUUCGUCAGCAGCCCUCCUCA… | 1956 nt | 0.4949 |
Summary
This gene is one member of a family of nuclear RNA export factor genes. Common domain features of this family are a noncanonical RNP-type RNA-binding domain (RBD), 4 leucine-rich repeats (LRRs), a nuclear transport factor 2 (NTF2)-like domain that allows heterodimerization with NTF2-related export protein-1 (NXT1), and a ubiquitin-associated domain that mediates interactions with nucleoporins. The LRRs and NTF2-like domains are required for export activity. Alternative splicing seems to be a common mechanism in this gene family. The encoded protein of this gene has shortened LRR and ubiquitin-associated domains and its RDB is unable to bind RNA. It is located in the nucleoplasm but is not associated with either the nuclear envelope or the nucleolus. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
No relevant information is available at the moment.