Basic Information

Symbol
NXNL2
RNA class
mRNA
Alias
Nucleoredoxin Like 2 RdCVF2 Rod-Derived Cone Viability Factor 2 C9orf121 Nucleoredoxin-Like Protein 2 Chromosome 9 Open Reading Frame 121 RdCVF2L
Location (GRCh38)
9:88534033-88584274
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001161625.2
Sequence length
1154.0 nt
GC content
0.5572

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-460.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -480.86 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 235.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001161625.2 NCBI
AGAGGCGGGUGCCGCGCUGUCGCCCAGGUAUCUGGGGUCUCUGGUGUCU… 1154 nt 0.5572
NM_145283.3 NCBI
AGAGGCGGGUGCCGCGCUGUCGCCCAGGUAUCUGGGGUCUCUGGUGUCU… 1388 nt 0.5295
Summary

Predicted to be involved in sensory perception of smell and visual perception. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in Wistar-albino rats demonstrated that the NXNL2 gene was up-regulated at 12 hours post-mild traumatic brain injury and subsequently down-regulated at 48 hours, identifying it as part of a gene interaction network responding to injury [Colak et al. DOI:10.1016/j.injury.2012.01.021].