Basic Information

Symbol
OAS1
RNA class
mRNA
Alias
2''-5''-Oligoadenylate Synthetase 1 2'-5'-Oligoadenylate Synthetase 1 OIASI IFI-4 OIAS 2'-5'-Oligoadenylate Synthetase 1, 40/46kDa 2'-5'-Oligoadenylate Synthase 1 (2-5')Oligo(A) Synthase 1 2-5A Synthase 1 E18/E16 2',5'-Oligoadenylate Synthetase 1 (40-46 KD) 2'-5'-Oligoadenylate Synthase 1 Isoform P42 2'-5'-Oligoisoadenylate Synthetase 1 2'-5' Oligoadenylate Synthase 1 E16 (2'-5') Oligo A Synthetase 2',5'-Oligo A Synthetase 1 2-5A Synthetase 1 P46/P42 OAS EC 2.7.7.84 EC 2.7.7 IMD100
Location (GRCh38)
12:112905856-112933219
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016816.4
Sequence length
1631.0 nt
GC content
0.5071

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-530.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -559.59 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 318.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001032409.3 NCBI
AGUCCAAGCUCAGUCAGCAGAAGAGAUAAAAGCAAACAGGUCUGGGAGG… 1533 nt 0.5101
NM_001320151.2 NCBI
AGUCCAAGCUCAGUCAGCAGAAGAGAUAAAAGCAAACAGGUCUGGGAGG… 2458 nt 0.4825
NM_001406020.1 NCBI
AGUCCAAGCUCAGUCAGCAGAAGAGAUAAAAGCAAACAGGUCUGGGAGG… 1509 nt 0.5142
NM_001406021.1 NCBI
AGUCCAAGCUCAGUCAGCAGAAGAGAUAAAAGCAAACAGGUCUGGGAGG… 1607 nt 0.5109
NM_001406022.1 NCBI
AGUCCAAGCUCAGUCAGCAGAAGAGAUAAAAGCAAACAGGUCUGGGAGG… 2423 nt 0.5126
NM_001406023.1 NCBI
AGUCCAAGCUCAGUCAGCAGAAGAGAUAAAAGCAAACAGGUCUGGGAGG… 2399 nt 0.5152
NM_001406024.1 NCBI
AGUCCAAGCUCAGUCAGCAGAAGAGAUAAAAGCAAACAGGUCUGGGAGG… 3295 nt 0.4850
NM_001406025.1 NCBI
AGUCCAAGCUCAGUCAGCAGAAGAGAUAAAAGCAAACAGGUCUGGGAGG… 2434 nt 0.4848
NM_001406026.1 NCBI
AGUCCAAGCUCAGUCAGCAGAAGAGAUAAAAGCAAACAGGUCUGGGAGG… 1059 nt 0.4873
NM_001406027.1 NCBI
AGUCCAAGCUCAGUCAGCAGAAGAGAUAAAAGCAAACAGGUCUGGGAGG… 1157 nt 0.4849
Showing 1 to 10 of 15 entries
Summary

This interferon-induced gene encodes a protein that synthesizes 2',5'-oligoadenylates (2-5As). This protein plays a key role in innate cellular antiviral response, and has been implicated in other cellular processes like cell growth and apoptosis. Alternative splicing results in multiple transcript variants with different enzymatic activities. Polymorphisms in this gene have been associated with susceptibility to viral infection, including SARS-CoV-2, and diabetes mellitus, type 1. This gene is located in a cluster of related genes on chromosome 12. [provided by RefSeq, May 2022]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the OAS1 is a member of a brain gene co-expression module associated with voluntary alcohol consumption, though its expression was not significantly altered following genetic disruption of the hub long non-coding RNA Lrap [Saba et al. DOI:10.1111/Gbb.12698].