Basic Information

Symbol
OAS2
RNA class
mRNA
Alias
2''-5''-Oligoadenylate Synthetase 2 2'-5'-Oligoadenylate Synthetase 2 2'-5'-Oligoadenylate Synthetase 2, 69/71kDa 2'-5'-Oligoadenylate Synthase 2 P69 OAS / P71 OAS 2-5A Synthase 2 2'-5'-Oligoadenylate Synthetase 2 (69-71 KD) (2'-5')Oligo(A) Synthetase 2 (2-5')Oligo(A) Synthase 2 P69OAS / P71OAS EC 2.7.7.84 EC 2.7.7
Location (GRCh38)
12:112978395-113011723
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002535.3
Sequence length
4622.0 nt
GC content
0.4686

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1408.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1495.60 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1032.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001032731.2 NCBI
AGUUUCAGUUUCCUGGCUCUGGGCAGCAGCAAGAAUUCCUCUGCCUCCC… 2035 nt 0.4531
NM_002535.3 NCBI
AGUUUCAGUUUCCUGGCUCUGGGCAGCAGCAAGAAUUCCUCUGCCUCCC… 4622 nt 0.4686
NM_016817.3 NCBI
AGUUUCAGUUUCCUGGCUCUGGGCAGCAGCAAGAAUUCCUCUGCCUCCC… 3489 nt 0.4718
Summary

This gene encodes a member of the 2-5A synthetase family, essential proteins involved in the innate immune response to viral infection. The encoded protein is induced by interferons and uses adenosine triphosphate in 2'-specific nucleotidyl transfer reactions to synthesize 2',5'-oligoadenylates (2-5As). These molecules activate latent RNase L, which results in viral RNA degradation and the inhibition of viral replication. The three known members of this gene family are located in a cluster on chromosome 12. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in pigs demonstrated that cold exposure uniquely upregulated the OAS2 in the skeletal muscle of cold-sensitive Bama pigs, where it was identified as a gene marker for immune/inflammatory response [Yang et al. DOI:10.3390/ijms24087431].