Basic Information

Symbol
OAS3
RNA class
mRNA
Alias
2''-5''-Oligoadenylate Synthetase 3 2'-5'-Oligoadenylate Synthetase 3 2'-5'-Oligoadenylate Synthetase 3, 100kDa 2'-5'-Oligoadenylate Synthase 3 (2-5')Oligo(A) Synthase 3 2-5A Synthase 3 P100 OAS P100OAS 2'-5'-Oligoadenylate Synthetase 3 (100 KD) 2'-5'Oligoadenylate Synthetase P100 (2-5')Oligo(A) Synthetase 3 2-5A Synthetase 3 EC 2.7.7.84 EC 2.7.7 P100
Location (GRCh38)
12:112938051-112976460
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006187.4
Sequence length
6599.0 nt
GC content
0.5407

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2428.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2547.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1558.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001410984.1 NCBI
AGAAAUCCGAAGGCCGCGCCAGAGCCCUGCUUCCCCUUGCACCUGCGCC… 6446 nt 0.5389
NM_006187.4 NCBI
AGAAAUCCGAAGGCCGCGCCAGAGCCCUGCUUCCCCUUGCACCUGCGCC… 6599 nt 0.5407
Summary

This gene encodes an enzyme included in the 2', 5' oligoadenylate synthase family. This enzyme is induced by interferons and catalyzes the 2', 5' oligomers of adenosine in order to bind and activate RNase L. This enzyme family plays a significant role in the inhibition of cellular protein synthesis and viral infection resistance. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans identified the OAS3 as a differentially expressed mRNA downregulated in the peripheral blood of sepsis patients compared to healthy controls [Qin et al. DOI: 10.1097/JCMA.0000000000000209].