Basic Information

Symbol
OAT
RNA class
mRNA
Alias
Ornithine Aminotransferase HOGA Ornithine Aminotransferase, Mitochondrial Ornithine Delta-Aminotransferase Gyrate Atrophy EC 2.6.1.13 Ornithine Aminotransferase Precursor Ornithine--Oxo-Acid Aminotransferase Ornithine-Oxo-Acid Aminotransferase Testicular Tissue Protein Li 130 EC 2.6.1 OATASE GACR OKT
Location (GRCh38)
10:124397298-124419760
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000274.4
Sequence length
2039.0 nt
GC content
0.4100

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-558.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -599.88 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 660.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000274.4 NCBI
GUUGCGCUUCAUAGACGCCGCGUGUACCCGGUUGUCCUCAGGCGCUGUC… 2039 nt 0.4100
NM_001171814.2 NCBI
GUUGCGCUUCAUAGACGCCGCGUGUACCCGGUUGUCCUCAGGCGCUGUC… 1811 nt 0.4081
NM_001322965.2 NCBI
GUUGCGCUUCAUAGACGCCGCGUGUACCCGGUUGUCCUCAGGCGCUAUC… 2034 nt 0.4095
NM_001322966.2 NCBI
GUUGCGCUUCAUAGACGCCGCGUGUACCCGGUUGUCCUCAGGCGCUGUC… 2354 nt 0.4070
NM_001322967.2 NCBI
GUUGCGCUUCAUAGACGCCGCGUGUACCCGGUUGUCCUCAGGCGCUGUC… 2159 nt 0.4169
NM_001322968.2 NCBI
GUUGCGCUUCAUAGACGCCGCGUGUACCCGGUUGUCCUCAGGCGCUGUC… 2246 nt 0.4167
NM_001322969.2 NCBI
GUUGCGCUUCAUAGACGCCGCGUGUACCCGGUUGUCCUCAGGCGCUGUC… 2126 nt 0.4102
NM_001322970.2 NCBI
GUUGCGCUUCAUAGACGCCGCGUGUACCCGGUUGUCCUCAGGCGCUGUC… 2342 nt 0.4163
NM_001322971.2 NCBI
GUUGCGCUUCAUAGACGCCGCGUGUACCCGGUUGUCCUCAGGCGCUGUC… 1718 nt 0.4121
NM_001322974.2 NCBI
GUUGCGCUUCAUAGACGCCGCGUGUACCCGGUUGUCCUCAGGCGCUGUC… 1925 nt 0.4109
Summary

This gene encodes the mitochondrial enzyme ornithine aminotransferase, which is a key enzyme in the pathway that converts arginine and ornithine into the major excitatory and inhibitory neurotransmitters glutamate and GABA. Mutations that result in a deficiency of this enzyme cause the autosomal recessive eye disease Gyrate Atrophy. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. Related pseudogenes have been defined on the X chromosome. [provided by RefSeq, Jan 2010]

Forensic Context

A study in BALB/c mice demonstrated that dietary methylmercury exposure significantly altered hippocampal protein and RNA expression, with ornithine aminotransferase (OAT) being upregulated at both the protein and RNA transcript levels in the high-dose exposure group [Mellingen et al. DOI:10.1093/Mtomcs/Mfab022].