Basic Information

Symbol
ODAD2
RNA class
mRNA
Alias
Outer Dynein Arm Docking Complex Subunit 2 CILD23 ARMC4 Gudu Outer Dynein Arm-Docking Complex Subunit 2 Armadillo Repeat-Containing Protein 4 Armadillo Repeat Containing 4 DKFZP434P1735 FLJ10817 FLJ10376 Testis Tissue Sperm-Binding Protein Li 74n
Location (GRCh38)
10:27775186-27999532
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018076.5
Sequence length
3603.0 nt
GC content
0.4308

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1011.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1084.60 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 747.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001290020.2 NCBI
ACAAGGGCGCCGGCGUGCGCGGCCGCAGGGCGCGCAGUGUUGACCCGCG… 3612 nt 0.4330
NM_001290021.2 NCBI
ACUUCUCUGCUGAACAGCAGAGUGCCUUACAUGCAUAUAGGAGGGCAAA… 2523 nt 0.4380
NM_001312689.2 NCBI
AGUCUUCCUUUAGCUGAUUCUAAUGACGGAGCCUAAUAACCUAGCCUGG… 2742 nt 0.4311
NM_018076.5 NCBI
AGCGCGGGCGCAGAGCGUCUCUGGCGCGGGCAUACGGUGCAACGGGUCC… 3603 nt 0.4308
Summary

The protein encoded by this gene contains ten Armadillo repeat motifs (ARMs) and one HEAT repeat, and is thought to be involved in ciliary and flagellar movement. This protein has been shown to localize to the ciliary axonemes and at the ciliary base of respiratory cells. Studies indicate that mutations in this gene cause partial outer dynein arm (ODA) defects in respiratory cilia. The cilia of cells with mutations in this gene displayed either reduced ciliary beat frequency and amplitude, or, complete immotility. Some individuals with primary ciliary dyskensia (PCD) have been shown to have mutations in this gene. PCD is characterized by chronic airway disease and left/right body asymmetry defects. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Aug 2015]

Forensic Context

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