Basic Information

Symbol
OGDH
RNA class
mRNA
Alias
Oxoglutarate Dehydrogenase OGDC-E1 OGDH2 KGD1 E1k Thiamine Diphosphate (ThDP)-Dependent 2-Oxoglutarate Dehydrogenase Oxoglutarate (Alpha-Ketoglutarate) Dehydrogenase (Lipoamide) 2-Oxoglutarate Dehydrogenase Complex Component E1 2-Oxoglutarate Dehydrogenase, Mitochondrial Alpha-KGDH-E1 EC 1.2.4.2 OGDH-E1 HsOGDH E1o Oxoglutarate Dehydrogenase (Succinyl-Transferring) Alpha-Ketoglutarate Dehydrogenase Testicular Tissue Protein Li 131 Oxoglutarate Decarboxylase AKGDH OGDHD OGDC
Location (GRCh38)
7:44606549-44709070
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002541.4
Sequence length
4193.0 nt
GC content
0.5633

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1594.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1671.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1213.99
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001003941.3 NCBI
AUUCGGGUGGAGCUGAGCCGGAGACAGGCAGUUGUGAAAAACUUCAGGA… 1693 nt 0.5346
NM_001165036.2 NCBI
AUUCGGGUGGAGCUGAGCCGGAGACAGGCAGUUGUGAAAAACUUCAGGA… 4181 nt 0.5606
NM_001363523.2 NCBI
AUUCGGGUGGAGCUGAGCCGGAGACAGGCAGUUGUGAAAAACUUCAGGA… 4226 nt 0.5592
NM_002541.4 NCBI
AUUCGGGUGGAGCUGAGCCGGAGACAGGCAGUUGUGAAAAACUUCAGGA… 4193 nt 0.5633
Summary

This gene encodes one subunit of the 2-oxoglutarate dehydrogenase complex. This complex catalyzes the overall conversion of 2-oxoglutarate (alpha-ketoglutarate) to succinyl-CoA and CO(2) during the Krebs cycle. The protein is located in the mitochondrial matrix and uses thiamine pyrophosphate as a cofactor. A congenital deficiency in 2-oxoglutarate dehydrogenase activity is believed to lead to hypotonia, metabolic acidosis, and hyperlactatemia. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms.[provided by RefSeq, Sep 2009]

Forensic Context

A study in aged C57BL/6 mice demonstrated that subacute thallium exposure significantly decreased renal protein levels of the OGDH, indicating inhibition of the TCA cycle and disrupted energy metabolism in both sexes [Yao et al. DOI:10.1016/J.Fct.2025.115700].