Basic Information

Symbol
OGDHL
RNA class
mRNA
Alias
Oxoglutarate Dehydrogenase L 2-Oxoglutarate Dehydrogenase Complex Component E1-Like 2-Oxoglutarate Dehydrogenase-Like, Mitochondrial Alpha-Ketoglutarate Dehydrogenase-Like Oxoglutarate Dehydrogenase Like OGDC-E1-Like EC 1.2.4.2 FLJ10851 KIAA1290 YOBELN
Location (GRCh38)
10:49734641-49762392
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018245.3
Sequence length
3706.0 nt
GC content
0.5853

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1485.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1548.60 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 956.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001143996.2 NCBI
ACGGCGCGCGCGCACCCCUUCCGCGCAGCCCCCUGACCUGCAGCCUCCG… 3535 nt 0.5847
NM_001143997.2 NCBI
ACGGCGCGCGCGCACCCCUUCCGCGCAGCCCCCUGACCUGCAGCCUCCG… 3330 nt 0.5823
NM_001347819.1 NCBI
AGGGUCCUGCGCAGAGGAGCGGGUGCUCGCGAAUGAGUCAGCUGAGGCU… 3652 nt 0.5811
NM_001347820.1 NCBI
GAGUCUCAGGGGCGCGCGCCCGUGGGCGGCUGCGUCACGUGACCCAGAA… 3497 nt 0.5814
NM_001347821.2 NCBI
ACGGCGCGCGCGCACCCCUUCCGCGCAGCCCCCUGACCUGCAGCCUCCG… 4017 nt 0.5823
NM_001347822.1 NCBI
GAGUCUCAGGGGCGCGCGCCCGUGGGCGGCUGCGUCACGUGACCCAGAU… 3292 nt 0.5787
NM_001347823.1 NCBI
GAGUCUCAGGGGCGCGCGCCCGUGGGCGGCUGCGUCACGUGACCCAGAA… 3488 nt 0.5837
NM_001347824.2 NCBI
ACGGCGCGCGCGCACCCCUUCCGCGCAGCCCCCUGACCUGCAGCCUCCG… 3526 nt 0.5871
NM_001347825.2 NCBI
ACGGCGCGCGCGCACCCCUUCCGCGCAGCCCCCUGACCUGCAGCCUCCG… 3837 nt 0.5838
NM_001347826.1 NCBI
GAGUCUCAGGGGCGCGCGCCCGUGGGCGGCUGCGUCACGUGACCCAGAA… 3397 nt 0.5826
Showing 1 to 10 of 11 entries
Summary

The protein encoded by this gene is similar to oxoglutarate dehydrogenase (OGDH) of the OGDH complex, which degrades glucose and glutamate. This gene encodes several isoforms, including some that appear to localize to mitochondria. The encoded protein down-regulates the AKT signaling cascade and can suppress the growth of cervical cancer cells. [provided by RefSeq, Dec 2016]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that acute ethanol exposure induces an open chromatin state at the promoter of the OGDHL gene in the amygdala, as identified by ATAC-seq analysis [Krishnan et al. DOI:10.1038/S41380-022-01732-2].