Basic Information

Symbol
OGDHL
RNA class
mRNA
Alias
Oxoglutarate Dehydrogenase L 2-Oxoglutarate Dehydrogenase Complex Component E1-Like 2-Oxoglutarate Dehydrogenase-Like, Mitochondrial Alpha-Ketoglutarate Dehydrogenase-Like Oxoglutarate Dehydrogenase Like OGDC-E1-Like EC 1.2.4.2 FLJ10851 KIAA1290 YOBELN
Location (GRCh38)
10:49734641-49762392
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018245.3
Sequence length
3706.0 nt
GC content
0.5853

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1485.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1548.60 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 956.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_018245.3 NCBI
ACGGCGCGCGCGCACCCCUUCCGCGCAGCCCCCUGACCUGCAGCCUCCG… 3706 nt 0.5853
Showing 11 to 11 of 11 entries
Summary

The protein encoded by this gene is similar to oxoglutarate dehydrogenase (OGDH) of the OGDH complex, which degrades glucose and glutamate. This gene encodes several isoforms, including some that appear to localize to mitochondria. The encoded protein down-regulates the AKT signaling cascade and can suppress the growth of cervical cancer cells. [provided by RefSeq, Dec 2016]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that acute ethanol exposure induces an open chromatin state at the promoter of the OGDHL gene in the amygdala, as identified by ATAC-seq analysis [Krishnan et al. DOI:10.1038/S41380-022-01732-2].