Basic Information

Symbol
OGFR
RNA class
mRNA
Alias
Opioid Growth Factor Receptor Zeta-Type Opioid Receptor Protein 7-60 7-60 OGFr
Location (GRCh38)
20:62804178-62814000
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_007346.4
Sequence length
2410.0 nt
GC content
0.6651

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1085.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1125.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 664.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_007346.4 NCBI
AGCGCGAGCCCCGCCGCCGCCGAGCAUGGACGACCCCGACUGCGACUCC… 2410 nt 0.6651
Summary

The protein encoded by this gene is a receptor for opioid growth factor (OGF), also known as [Met(5)]-enkephalin. OGF is a negative regulator of cell proliferation and tissue organization in a variety of processes. The encoded unbound receptor for OGF has been localized to the outer nuclear envelope, where it binds OGF and is translocated into the nucleus. The coding sequence of this gene contains a polymorphic region of 60 nt tandem imperfect repeat units. Several transcripts containing between zero and eight repeat units have been reported. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in zebrafish and mouse demonstrated that the OGFR transcript, categorized as a development gene involved in embryonic development, increased in relative abundance within 0.3 hours postmortem in zebrafish [Pozhitkov et al. DOI:10.1098/rsob.160267].