Basic Information

Symbol
OGT
RNA class
mRNA
Alias
O-Linked N-Acetylglucosamine (GlcNAc) Transferase O-GLCNAC HRNT1 OGT1 O-Linked N-Acetylglucosamine (GlcNAc) Transferase (UDP-N-Acetylglucosamine:Polypeptide-N-Acetylglucosaminyl Transferase) UDP-N-Acetylglucosamine--Peptide N-Acetylglucosaminyltransferase 110 KDa Subunit UDP-N-Acetylglucosamine:Polypeptide-N-Acetylglucosaminyl Transferase O-Linked N-Acetylglucosamine Transferase 110 KDa Subunit O-GlcNAc Transferase Subunit P110 MGC22921 FLJ23071 Uridinediphospho-N-Acetylglucosamine:Polypeptide Beta-N-Acetylglucosaminyl Transferase O-GlcNAc Transferase P110 Subunit EC 2.4.1.255 EC 2.4.1.186 HINCUT-1 EC 2.4.1 XLID106 MRX106
Location (GRCh38)
X:71533083-71575892
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_181672.3
Sequence length
5435.0 nt
GC content
0.4212

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1600.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1701.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1610.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_181672.3 NCBI
AUUUCAAGACCGUACUAGGUAGAUGGUCAAUUAGAGUUCCCAGGGUUUG… 5435 nt 0.4212
NM_181673.3 NCBI
AUUUCAAGACCGUACUAGGUAGAUGGUCAAUUAGAGUUCCCAGGGUUUG… 5405 nt 0.4211
Summary

This gene encodes a glycosyltransferase that catalyzes the addition of a single N-acetylglucosamine in O-glycosidic linkage to serine or threonine residues. Since both phosphorylation and glycosylation compete for similar serine or threonine residues, the two processes may compete for sites, or they may alter the substrate specificity of nearby sites by steric or electrostatic effects. The protein contains multiple tetratricopeptide repeats that are required for optimal recognition of substrates. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2009]

Forensic Context

A study in humans undergoing cardiac surgery with cardiopulmonary bypass demonstrated that acute left ventricular ischemia induces significant changes in microRNA and mRNA expression [Saddic et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00049.2015].