Basic Information

Symbol
OLFM1
RNA class
mRNA
Alias
Olfactomedin 1 NOE1 NOELIN OlfA AMY Neuronal Olfactomedin-Related ER Localized Protein Noelin1 Olfactomedin Related ER Localized Protein Neuroblastoma Protein Olfactomedin-1 Pancortin 1 Pancortin Noelin NOEL1
Location (GRCh38)
9:135075422-135121180
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001282611.2
Sequence length
2782.0 nt
GC content
0.5615

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1060.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1107.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 643.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001282611.2 NCBI
AGAGCCGGACGGCGCUUCCCGGUGGCGGCGGAGGAGCCCGGAGGGACGC… 2782 nt 0.5615
NM_001282612.1 NCBI
GAAUCACCGCGGAAAAGGGCUCCAGUAGGCAGGACGGCGCCGUCUCUCU… 2502 nt 0.5288
NM_006334.4 NCBI
AGACGCGCCGGAACCGGGACGCGAUAAAUAUGCAGAGCGGAGGCUUCGC… 928 nt 0.5409
NM_014279.5 NCBI
AGACGCGCCGGAACCGGGACGCGAUAAAUAUGCAGAGCGGAGGCUUCGC… 2608 nt 0.5376
Summary

This gene product shares extensive sequence similarity with the rat neuronal olfactomedin-related ER localized protein. While the exact function of the encoded protein is not known, its abundant expression in brain suggests that it may have an essential role in nerve tissue. Several alternatively spliced transcripts encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the OLFM1 was upregulated in a specific astrocyte subcluster in post-mortem brain tissue and is associated with cell viability, inducing cell necrosis and apoptosis [Guo et al. DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147708]. In human forensic research, the OLFM1 was evaluated as a candidate mRNA marker for brain tissue identification but was not mentioned in the study's introduction or discussion and was not experimentally studied in the developed multiplex assay [Lindenbergh et al. DOI:10.1007/s00414-013-0895-7].