Basic Information

Symbol
OLFM4
RNA class
mRNA
Alias
Olfactomedin 4 GW112 OlfD PDP4 GC1 G-CSF-Stimulated Clone 1 Protein Antiapoptotic Protein GW112 Olfactomedin-4 Olfactoimedin Tiarin HGC-1 HOLfD OLM4 BA209J19.1 UNQ362
Location (GRCh38)
13:53028813-53052057
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006418.5
Sequence length
2843.0 nt
GC content
0.4231

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-827.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -881.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 657.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006418.5 NCBI
AGCGGCUCCAGCUAAGAGGACAAGAUGAGGCCCGGCCUCUCAUUUCUCC… 2843 nt 0.4231
Summary

This gene was originally cloned from human myeloblasts and found to be selectively expressed in inflammed colonic epithelium. This gene encodes a member of the olfactomedin family. The encoded protein is an antiapoptotic factor that promotes tumor growth and is an extracellular matrix glycoprotein that facilitates cell adhesion. [provided by RefSeq, Mar 2011]

Forensic Context

A study in human patients identified OLFM4 as a key mRNA biomarker, with RNA-sequencing of peripheral blood showing it was upregulated in sepsis patients compared to healthy controls [Qin et al. DOI:10.1097/JCMA.0000000000000209].