Basic Information

Symbol
OLIG1
RNA class
mRNA
Alias
Oligodendrocyte Transcription Factor 1 BHLHe21 BHLHB6 Oligodendrocyte-Specific BHLH Transcription Factor 1 Basic Domain, Helix-Loop-Helix Protein, Class B, 6 Oligodendrocyte Lineage Transcription Factor 1 Class E Basic Helix-Loop-Helix Protein 21 Class B Basic Helix-Loop-Helix Protein 6 Oligo1 BHLHE21 BHLHb6
Location (GRCh38)
21:33070141-33072413
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_138983.3
Sequence length
2273.0 nt
GC content
0.6480

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1020.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1060.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 614.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_138983.3 NCBI
ACCAUCGUUUCCCCGCGCGCAGGUCCGCGGGGAGGGGCGGCCUGCCGAC… 2273 nt 0.6480
Summary

Predicted to enable DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific and E-box binding activity. Predicted to be involved in axon development; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; and sensory organ development. Predicted to act upstream of or within neuron fate commitment. Predicted to be located in chromatin. Predicted to be active in nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that perinatal lead (Pb) exposure was associated with a 12.4% increase in oligodendrocytes in the adult hippocampus and altered gene expression in specific cell clusters [Bakulski et al. DOI:10.1093/toxsci/kfaa069].