Basic Information

Symbol
OPA1
RNA class
mRNA
Alias
OPA1 Mitochondrial Dynamin Like GTPase KIAA0567 MGM1 NTG NPG Dynamin-Like 120 KDa Protein, Mitochondrial Dynamin-Like GTPase OPA1, Mitochondrial Dynamin-Like Guanosine Triphosphatase Optic Atrophy 1 (Autosomal Dominant) Mitochondrial Dynamin-Like GTPase Optic Atrophy Protein 1 FLJ12460 OPA1, Mitochondrial Dynamin Like GTPase EC 3.6.5.5 MTDPS14 LargeG BERHS
Location (GRCh38)
3:193593144-193697811
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_130837.3
Sequence length
6429.0 nt
GC content
0.3816

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1605.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1740.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1907.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001354663.2 NCBI
AGGCUCUUGCGGAAGUCCAUGCGCCAUUGGGAGGGCCUCGGCCGCGGCU… 6325 nt 0.3823
NM_001354664.2 NCBI
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NM_015560.3 NCBI
AGGCUCUUGCGGAAGUCCAUGCGCCAUUGGGAGGGCCUCGGCCGCGGCU… 6264 nt 0.3790
NM_130831.3 NCBI
AGGCUCUUGCGGAAGUCCAUGCGCCAUUGGGAGGGCCUCGGCCGCGGCU… 6156 nt 0.3791
NM_130832.3 NCBI
AGGCUCUUGCGGAAGUCCAUGCGCCAUUGGGAGGGCCUCGGCCGCGGCU… 6210 nt 0.3794
NM_130833.3 NCBI
AGGCUCUUGCGGAAGUCCAUGCGCCAUUGGGAGGGCCUCGGCCGCGGCU… 6267 nt 0.3815
NM_130834.3 NCBI
AGGCUCUUGCGGAAGUCCAUGCGCCAUUGGGAGGGCCUCGGCCGCGGCU… 6318 nt 0.3792
NM_130835.3 NCBI
AGGCUCUUGCGGAAGUCCAUGCGCCAUUGGGAGGGCCUCGGCCGCGGCU… 6321 nt 0.3817
NM_130836.3 NCBI
AGGCUCUUGCGGAAGUCCAUGCGCCAUUGGGAGGGCCUCGGCCGCGGCU… 6375 nt 0.3813
NM_130837.3 NCBI
AGGCUCUUGCGGAAGUCCAUGCGCCAUUGGGAGGGCCUCGGCCGCGGCU… 6429 nt 0.3816
Summary

The protein encoded by this gene is a nuclear-encoded mitochondrial protein with similarity to dynamin-related GTPases. The encoded protein localizes to the inner mitochondrial membrane and helps regulate mitochondrial stability and energy output. This protein also sequesters cytochrome c. Mutations in this gene have been associated with optic atrophy type 1, which is a dominantly inherited optic neuropathy resulting in progressive loss of visual acuity, leading in many cases to legal blindness. [provided by RefSeq, Aug 2017]

Forensic Context

A longitudinal mRNA expression analysis in post-mortem human blood samples demonstrated that the OPA1 shows an up-regulated expression pattern after death and is involved in pathways promoting cell survival, such as the establishment of mitochondrion localization and positive regulation of insulin receptor signaling [Antiga et al. DOI:10.1038/s41598-021-96095-z].