Basic Information

Symbol
OPALIN
RNA class
mRNA
Alias
Oligodendrocytic Myelin Paranodal And Inner Loop Protein HTMP10 Transmembrane Protein 10 TMEM10 TMP10 Opalin Transmembrane Protein TMP10
Location (GRCh38)
10:96343216-96359365
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_033207.5
Sequence length
3252.0 nt
GC content
0.4376

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-943.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1009.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 788.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001040102.3 NCBI
GUCAGUUAACUGUUCCUACAAAUGAAAGACACAAGCCAAUAAAGCCAGU… 3183 nt 0.4358
NM_001040103.3 NCBI
GUCAGUUAACUGUUCCUACAAAUGAAAGACACAAGCCAAUAAAGCCAGU… 3291 nt 0.4391
NM_001284320.2 NCBI
GUCAGUUAACUGUUCCUACAAAUGAAAGACACAAGCCAAUAAAGCCAGU… 3219 nt 0.4365
NM_001284321.2 NCBI
GUCAGUUAACUGUUCCUACAAAUGAAAGACACAAGCCAAUAAAGCCAGU… 3216 nt 0.4369
NM_001284322.2 NCBI
GUCAGUUAACUGUUCCUACAAAUGAAAGACACAAGCCAAUAAAGCCAGU… 3334 nt 0.4388
NM_001284323.2 NCBI
AGUGCAGCGACCAUCCAGUGUCCUUGCAGCACGUGUUGGUCUGGUGCUA… 3432 nt 0.4484
NM_001284324.2 NCBI
AGUGCAGCGACCAUCCAGUGUCCUUGCAGCACGUGUUGGUCUGGUGCUA… 3325 nt 0.4451
NM_001284326.2 NCBI
AGUGCAGCGACCAUCCAGUGUCCUUGCAGCACGUGUUGGUCUGGUGCUA… 3393 nt 0.4471
NM_001284327.2 NCBI
AGUGCAGCGACCAUCCAGUGUCCUUGCAGCACGUGUUGGUCUGGUGCUA… 3286 nt 0.4437
NM_033207.5 NCBI
GUCAGUUAACUGUUCCUACAAAUGAAAGACACAAGCCAAUAAAGCCAGU… 3252 nt 0.4376
Summary

Predicted to be involved in regulation of oligodendrocyte differentiation. Located in Golgi apparatus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the OPALIN is a highly specific mRNA marker for brain identification, showing no co-expression in other tissues in silico and being reliably detected in post-mortem brain samples with an average RFU of 7905 [Broderius et al. DOI:10.1007/s00414-025-03494-2]. In a separate specificity assessment, the OPALIN exhibited no unexpected signals in non-target human organ tissues or body fluids when tested, confirming its utility for forensic organ tissue inference [van den Berge & Sijen DOI:10.1002/elps.201700241].