Basic Information

Symbol
OPRK1
RNA class
mRNA
Alias
Opioid Receptor Kappa 1 OPRK KOR Kappa-Type Opioid Receptor K-OR-1 KOR-1 Opioid Receptor, Kappa 1 Opiate Receptor, Kappa-1 Kappa Opioid Receptor KOR1 KOP
Location (GRCh38)
8:53225724-53251637
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000912.5
Sequence length
4954.0 nt
GC content
0.4471

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1554.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1643.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1098.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000912.5 NCBI
AGUAGUGGGAGACGUGCGCUGAGAGGCGGGGGCUGCGCUCGGCGGAACA… 4954 nt 0.4471
NM_001282904.2 NCBI
AGUAGUGGGAGACGUGCGCUGAGAGGCGGGGGCUGCGCUCGGCGGAACA… 5128 nt 0.4511
NM_001318497.2 NCBI
AGUAGUGGGAGACGUGCGCUGAGAGGCGGGGGCUGCGCUCGGCGGAACA… 4954 nt 0.4471
Summary

This gene encodes an opioid receptor, which is a member of the 7 transmembrane-spanning G protein-coupled receptor family. It functions as a receptor for endogenous ligands, as well as a receptor for various synthetic opioids. Ligand binding results in inhibition of adenylate cyclase activity and neurotransmitter release. This opioid receptor plays a role in the perception of pain and mediating the hypolocomotor, analgesic and aversive actions of synthetic opioids. Variations in this gene have also been associated with alcohol dependence and opiate addiction. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. A recent study provided evidence for translational readthrough in this gene, and expression of an additional C-terminally extended isoform via the use of an alternative in-frame translation termination codon. [provided by RefSeq, Dec 2017]

Forensic Context

A study in Wistar-albino rats demonstrated that the gene Oprk1, identified via microarray analysis as part of the brain's response to mild traumatic brain injury, was down-regulated at 12 hours post-trauma and subsequently up-regulated at 48 hours [Colak et al. DOI:10.1016/j.injury.2012.01.021].