Basic Information

Symbol
ARMCX1
RNA class
mRNA
Alias
Armadillo Repeat Containing X-Linked 1 ALEX1 GASP7 ARM Protein Lost In Epithelial Cancers On Chromosome X 1 Armadillo Repeat-Containing X-Linked Protein 1 Arm Protein Lost In Epithelial Cancers, X Chromosome, 1 Protein ALEX1
Location (GRCh38)
X:101550411-101554704
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016608.2
Sequence length
2125.0 nt
GC content
0.4518

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-655.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -693.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 509.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_016608.2 NCBI
GUCCUUCUAAUCCUAGUCUUCGUUUGGUCCGGUUGCACUCUUCCUAUAG… 2125 nt 0.4518
Summary

This gene encodes a member of the ALEX family of proteins and may play a role in tumor suppression. The encoded protein contains a potential N-terminal transmembrane domain and two Armadillo (arm) repeats. Other proteins containing the arm repeat are involved in development, maintenance of tissue integrity, and tumorigenesis. This gene is closely localized with other family members, including ALEX2 and ALEX3, on the X chromosome. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans identified the ARMCX1 as a hub gene in the sky-blue co-expression module of platelets from ST-segment elevation myocardial infarction (STEMI) patients, where it was associated with functions related to cell membrane signal transduction [Zhang et al. DOI:PMC8129354].