Basic Information

Symbol
OR2V1
RNA class
mRNA
Alias
Olfactory Receptor Family 2 Subfamily V Member 1 OST265 Olfactory Receptor 2V1 OR2V1P Olfactory Receptor, Family 2, Subfamily V, Member 1 Pseudogene Olfactory Receptor, Family 2, Subfamily V, Member 1
Location (GRCh38)
5:181123122-181131169
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001258283.2
Sequence length
2423.0 nt
GC content
0.4734

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-752.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -795.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 575.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001258283.2 NCBI
AGAACCGUGGACUUCAGCCCCAUCCCCAGCAGCCCACGAAGACACUGAC… 2423 nt 0.4734
Summary

Olfactory receptors interact with odorant molecules in the nose, to initiate a neuronal response that triggers the perception of a smell. The olfactory receptor proteins are members of a large family of G-protein-coupled receptors (GPCR) arising from single coding-exon genes. Olfactory receptors share a 7-transmembrane domain structure with many neurotransmitter and hormone receptors and are responsible for the recognition and G protein-mediated transduction of odorant signals. The olfactory receptor gene family is the largest in the genome. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans identified the OR2V1 mRNA as hypermethylated in the postmortem nucleus accumbens of subjects with alcohol use disorder compared to controls, with a mean methylation level of 0.623 in cases versus 0.274 in controls [Liu et al. DOI:10.3390/genes13060958].