Basic Information

Symbol
OR7A5
RNA class
mRNA
Alias
Olfactory Receptor Family 7 Subfamily A Member 5 HTPCR2 Olfactory Receptor, Family 7, Subfamily A, Member 5 Pseudogene Olfactory Receptor OR19-17 Olfactory Receptor TPCR92 Olfactory Receptor 7A5 Olfactory Receptor, Family 7, Subfamily A, Member 5
Location (GRCh38)
19:14826241-14835185
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017506.2
Sequence length
2126.0 nt
GC content
0.4106

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-516.98 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -559.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 689.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001370480.1 NCBI
ACUCUUUCCUGCUGCCUAGUCUGCUGAGCAGAGCUUCAGUCUCCACCAU… 2276 nt 0.4244
NM_001370481.1 NCBI
ACUCUUUCCUGCUGCCUAGUCUGCUGAGCAGAGCUUCAGUCUCCACCAU… 2403 nt 0.4241
NM_001370482.1 NCBI
ACUCUUUCCUGCUGCCUAGUCUGCUGAGCAGAGCUUCAGUCUCCACCAU… 2287 nt 0.4171
NM_001370483.1 NCBI
ACUCUUUCCUGCUGCCUAGUCUGCUGAGCAGAGCUUCAGUCUCCACCAU… 2355 nt 0.4178
NM_017506.2 NCBI
ACUCUUUCCUGCUGCCUAGUCUGCUGAGCAGAGCUUCAGUCUCCACCAU… 2126 nt 0.4106
Summary

Olfactory receptors interact with odorant molecules in the nose, to initiate a neuronal response that triggers the perception of a smell. The olfactory receptor proteins are members of a large family of G-protein-coupled receptors (GPCR) arising from single coding-exon genes. Olfactory receptors share a 7-transmembrane domain structure with many neurotransmitter and hormone receptors and are responsible for the recognition and G protein-mediated transduction of odorant signals. The olfactory receptor gene family is the largest in the genome. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the OR7A5 was one of the four most significantly down-regulated mRNAs in traumatic brain injury tissue compared to adjacent control tissue [Yang et al. DOI:10.4103/1673-5374.247467].