Basic Information

Symbol
ORAI1
RNA class
mRNA
Alias
ORAI Calcium Release-Activated Calcium Modulator 1 CRACM1 Transmembrane Protein 142A TMEM142A Calcium Release-Activated Calcium Channel Protein 1 Calcium Release-Activated Calcium Modulator 1 Protein Orai-1 FLJ14466 ORAT1 IMD9 TAM2
Location (GRCh38)
12:121626509-121643109
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032790.4
Sequence length
2585.0 nt
GC content
0.5698

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1085.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1127.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 536.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_032790.4 NCBI
GCGCGCAGUCUCUGGUCACUGCCGCCCGGGGGCUUUUGCCAGCGGCGCC… 2585 nt 0.5698
Summary

The protein encoded by this gene is a membrane calcium channel subunit that is activated by the calcium sensor STIM1 when calcium stores are depleted. This type of channel is the primary way for calcium influx into T-cells. Defects in this gene are a cause of immune dysfunction with T-cell inactivation due to calcium entry defect type 1 (IDTICED1). [provided by RefSeq, Sep 2011]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.