Basic Information

Symbol
ORC1
RNA class
mRNA
Alias
Origin Recognition Complex Subunit 1 PARC1 Replication Control Protein 1 HSORC1 ORC1L Origin Recognition Complex, Subunit 1, S. Cerevisiae, Homolog-Like Origin Recognition Complex, Subunit 1 Homolog (S. Cerevisiae) Origin Recognition Complex, Subunit 1 (Yeast Homolog)-Like Origin Recognition Complex, Subunit 1-Like (Yeast) Origin Recognition Complex, Subunit 1 Homolog Origin Recognition Complex, Subunit 1 Origin Recognition Complex 1
Location (GRCh38)
1:52372010-52404471
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004153.4
Sequence length
3121.0 nt
GC content
0.5066

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1038.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1093.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 686.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001190818.2 NCBI
CCUUCCACCUUCUUUUCAUUUCUAGUGAGACACACGCUUUGGUCCUGGC… 3118 nt 0.5067
NM_001190819.2 NCBI
CCUUCCACCUUCUUUUCAUUUCUAGUGAGACACACGCUUUGGUCCUGGC… 3106 nt 0.5068
NM_004153.4 NCBI
CCUUCCACCUUCUUUUCAUUUCUAGUGAGACACACGCUUUGGUCCUGGC… 3121 nt 0.5066
Summary

The origin recognition complex (ORC) is a highly conserved six subunits protein complex essential for the initiation of the DNA replication in eukaryotic cells. Studies in yeast demonstrated that ORC binds specifically to origins of replication and serves as a platform for the assembly of additional initiation factors such as Cdc6 and Mcm proteins. The protein encoded by this gene is the largest subunit of the ORC complex. While other ORC subunits are stable throughout the cell cycle, the levels of this protein vary during the cell cycle, which has been shown to be controlled by ubiquitin-mediated proteolysis after initiation of DNA replication. This protein is found to be selectively phosphorylated during mitosis. It is also reported to interact with MYST histone acetyltransferase 2 (MyST2/HBO1), a protein involved in control of transcription silencing. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2010] CIViC Summary for ORC1 Gene

Forensic Context

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