Basic Information

Symbol
OSBPL3
RNA class
mRNA
Alias
Oxysterol Binding Protein Like 3 ORP-3 ORP3 KIAA0704 OSBP3 Oxysterol-Binding Protein-Related Protein 3 OSBP-Related Protein 3 Oxysterol Binding Protein-Like 3
Location (GRCh38)
7:24796540-24981634
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015550.4
Sequence length
6749.0 nt
GC content
0.4186

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1933.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2063.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1458.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_015550.4 NCBI
GAGAAGUUCUGGGCAAAGUACUCAGAACUGGCCGCGUGCUGGUGGCGCC… 6749 nt 0.4186
NM_145320.2 NCBI
GUUUUAGGGUUUCCUUUGGGCCACCCAAAAUGUUUUUUAAAUACUUUGG… 6366 nt 0.4043
NM_145321.2 NCBI
GUUUUAGGGUUUCCUUUGGGCCACCCAAAAUGUUUUUUAAAUACUUUGG… 6351 nt 0.4028
NM_145322.2 NCBI
GUUUUAGGGUUUCCUUUGGGCCACCCAAAAUGUUUUUUAAAUACUUUGG… 6258 nt 0.4017
Summary

This gene encodes a member of the oxysterol-binding protein (OSBP) family, a group of intracellular lipid receptors. Most members contain an N-terminal pleckstrin homology domain and a highly conserved C-terminal OSBP-like sterol-binding domain. The encoded protein is involved in the regulation of cell adhesion and organization of the actin cytoskeleton. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2013]

Forensic Context

A review of RNA-Seq studies in post-mortem human brains reported that the OSBPL3 exhibited altered expression in the dorsolateral prefrontal cortex of subjects with bipolar disorder, where it is implicated in circadian rhythm pathways [Wu et al. DOI:10.1111/Pcn.12550].