Basic Information

Symbol
OSBPL8
RNA class
mRNA
Alias
Oxysterol Binding Protein Like 8 OSBP10 ORP8 MSTP120 MST120 Oxysterol-Binding Protein-Related Protein 8 OSBP-Related Protein 8 Oxysterol Binding Protein-Like 8 KIAA1451 ORP-8
Location (GRCh38)
12:76351797-76559809
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_020841.5
Sequence length
7204.0 nt
GC content
0.3541

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1761.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1907.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2011.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001003712.2 NCBI
AGAAAGGCGGCGACGCGGCGGAUGACAACAUUAGGCCGCGACGCGCUCC… 7158 nt 0.3535
NM_001319652.2 NCBI
AGAAAGGCGGCGACGCGGCGGAUGACAACAUUAGGCCGCGACGCGCUCC… 7283 nt 0.3548
NM_001319653.2 NCBI
AGAAAGGCGGCGACGCGGCGGAUGACAACAUUAGGCCGCGACGCGCUCC… 7195 nt 0.3540
NM_001319655.2 NCBI
GUUUAUUCUCUGCUUUAACUGUUGGAAUCCAUCAACGUUGUGCUUGAAA… 7320 nt 0.3337
NM_020841.5 NCBI
AGAAAGGCGGCGACGCGGCGGAUGACAACAUUAGGCCGCGACGCGCUCC… 7204 nt 0.3541
Summary

This gene encodes a member of a family of proteins containing an N-terminal pleckstrin homology domain and a highly conserved C-terminal oxysterol-binding protein-like sterol-binding domain. It binds mutliple lipid-containing molecules, including phosphatidylserine, phosphatidylinositol 4-phosphate (PI4P) and oxysterol, and promotes their exchange between the endoplasmic reticulum and the plasma membrane. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2016]

Forensic Context

A study in the forensically important fly *Sarcophaga peregrina* demonstrated that the OSBPL8 was consistently up-regulated during postembryonic development from larval to pupal stages, a pattern validated by qRT-PCR [Ren et al. DOI:10.3390/insects13050453].