Basic Information

Symbol
OSMR
RNA class
mRNA
Alias
Oncostatin M Receptor OSMRB Oncostatin-M-Specific Receptor Subunit Beta OSMRbeta Interleukin-31 Receptor Subunit Beta IL-31 Receptor Subunit Beta IL-31R Subunit Beta IL-31R-Beta IL-31RB Oncostatin-M Specific Receptor Beta Subunit PLCA1
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Cause of death analysis Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_003999.3
Sequence length
5526.0 nt
GC content
0.4506

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1622.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1722.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1274.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((.....((.((((..(((((.((....))..)))))..)))).))..((....))((.(((((.((((((((....)))))..))).))))).))((((((((...((.(((((.((((((((...((((((((.....(((.(((((.((.(((((((((......((((...(((((((((((((((.....))).)))).))))))))...))))......)))))).......))).)).))))).)))(((((((((.(((((..........))).)).))....(((((((.........))))))).......))))))))))))).)))))).)))).)))))))..((..(((..((((.....((((..((((((((((..((((.(((((((..((((.((.............)).))))...)))))))...))))..)).(((((.(((((.(((((.((.((((((........................((((((.......))))))(((.(((((((((((.(((((....((((((.....(((.(((.((((((......)))))).))).)))((((((((((....((((((........))))))(((((((......(((((....)))))...((.((((((....((((((.((...)).))))))...)))))).))(((.((.((((((....)))))).)).)))(((......))))))))))((..(((......)))..))((((.(.(((((...))))).)))))......))))))))))((((((((((((((((.((((((......)).))))(((((........)))))(((((.((................)))))))....))))))))))))))))....))))))....(((...((((..((.((...)).))..))))...))).(((((...)))))..(((.(((......))).)))...)))))....)))))))))))))))))))))))))))))))).)))))......(((((.((((((....((((((......)))))).....)))))).((((((((((..((.((((.((((((((........)).)))))).)))).)).........((.((((((.(((.......))).)))))).))......(((((((......(((((.......)))))((...(((((.((.....)))))))...)))))))))........))))))))))..((((..((((........(((((((........(((..((((((.(.......)))))))..)))(((((...)))))..............)))))))........))))..)))).)))))......))))))).)..)))).)))))))..))....(((.((((((((((....))))..))))))...)))..))))))))......(((((....(((((((((((.....(((((.((((((((((......(((.((((((((..(((((((((...((.((.(((((((((((.((((....)))))))).((((...((((((((((((((((((((...(((((.......)))))..(((((((((.((..(((........)).)..)).))))...)))))(((.........)))))))).....(((((..(((((..((........))..)))))..........(((((((((...)))))))))...............)))))......)))))))).)))))))...)))).................(((((.(...(((((((.(((((..((((((.(((((((....((((.(((((.......)))))..)))).((((.(((((((...................((((((.((.........((.((((.((((((((......)))))))))))).)).)).))))))))))))))))).))))))).)))))).))))).))..)))))))))))))))))))).))((((...))))...((((((((................(((..((((.((((((((.....(((((((.(((...((((((((((........(((((.(((.....(((((..((..((((...((((..............))))...))))..))))))).))).)))))((((......))))...(((((((((..((((((((..((..((.(((((.((((((((((...(((((.......)))))......))))))....)))).)))))..))..))..)))).))))......((.((((((((.(......))))))))).)).(((.(((((((....................(((.(((..((((((((..(((..((.((...(((..((..(((((...((((........)))).....(((((((((((........))))))))).))....)))))))..).))..)).))..)))...))))))))..)))...)))(((((.(((((((.....((.....))..))))))).)).)))...((((((..(((((.((((..((((.........))))...)))))))))..)).)))).))))))).)))((((((..........(((.....)))..........)))))))))))))))...(((((...)))))...)))))))))))))..((((((((((((.........))))))(((...((((.((((((((.........))).)))))...))))....)))...(((..(((.....))).))).....)))))))))))))...)))))))).))))..))).)))))))).((((((((...))).).))))))).))))))...))))))))........(((((........((((((((..((((..((.(((.............)))..........(((((.......((((((((((....))))))..)))).....))))))).))))..)))))))).)))))......((((.((((((.......)))))).))))...(((((...(((((((....((...(((((((....((((...((((.....))))...)))).....(((........)))..((((((..((.(((..(((.........)))..))).))......))))))....(((.(((.(((((.((((..(((((((.(((.((..(((((((.(((((.(((.(((((.((((..(((.(((((((((((.((((((((((.((........(((((..........)))))......))))))...)))))).))))).))))))))).........((((.....))))...(((((...(((((((((((((..((..((((((.((............)).)))))).(((((((........(((((((.....(((((((((..(((...((.....((((((((((((((.......))).))))..)))))))((((((((((((....(((((....)))))((((....))))........((((......))))..((((((....))))))(((...((((.(.((((...))))).))))...))).......(((((.(.(((((....))))).).((((.(((((((((((.....((((.((((((((((......)).))))..)))).)))).((((...)))).........((((.((((.((((((((((((........((((((............((((..(((((.....))))).))))...........(((((.....((((((.....((((((((.((.(((.(..(((((.....)))))..))))(((((((.((((((...(((....))).(((((....))))).((((..((((......((((((....................((((.(((((((((.............))))))))).........)))).((((.......))))))))))....))))..))))(((((((......)))))))............(((((((...((((((((((........(((((....))))).)))).))))))...))))))).........)))))).)))))))......(((((((.((.((((((....)).))))...)).)))))))...((((((((((((.(((((((.(((.(((.....)))))).)))).))).))))))))....))))))))))))))..)))))).)))))........))))))..........)))).)))))))).)))).))))((((((.((...))))))))...........((((.(((((((((((.......)))))))))))......(((...))).)))).))))))))))).))))...(((((((...))))))))))))...(((...)))))))))))))))(((((((((((((((((((((((...(((.(((.....))).)))..........((((((((........))))))))....((.......))..)))))))...)).)))))........))))))).)).......)).)))..)))))))))...))))))).(((((....)))))((.(((((......((......))......))))).))......(((((((...)))))))((((.(((((.((..(((((((..(((....))).))))))).)))))))...))))((((.(...(((((......)))))...))))))))))))..))..))).)))))).....))))..)))))))))..)))))))).))))))))))))..)).)))..)).)))))))))))))))))..))).)))))))..))...)))))))......(((.((..(((........)))..)))))........(((((((((...........)))))))).)....)))))..............))).....)))))))))).))))))))))))))))((((((((.....)))))))).......(((..(((((..(((((((((....))))))))))))))))).))))))))))).........................(((((((((((((((....((((...(((((..........((((((.((..((((((((((((((...(((((((.(((......)))...)))))))......)).)))))....)))))))..)).)))))))))))...))))..)))))))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((..,,.((.{{(({{(((((,((.,,,||.,||}}}..}))),}}..((....}}((.(((((.((((((((....)))))..))).))))).))((((((((,(.((.(((((.((((((((..{((((((((.....(((.(((((.((.(((((((((,{({{{((((...,,,,,||||,|||||.},,{|||.,,,}})))),,}}...,}}}......)))))).......))).)).))))).)))(((((((({.(((((..........))).)).}}....(((((((.........)))))))......,))))))))))))))).)))).)))).)))))})})||..(((..((((.....((((..{(((((((,,,,(((({({{{((({{((((.{{,,,,,,,......},.}|||{{{|}||}||,..,}|}|||,.(((((.(((({,(((((.((.((((((.........,....,},.......{(((((.......)))))}(((.(((((((((((.(((((....{(((((.....(((.(((.((((((......)))))).))).)))((((((((((....((((((........))))))((((((({{{(..,..|})}},,(((({{{,,.|||||}}...((((((.((...)).))))))..{{||,||,||(((({{,((((((....}))))).)).}})))),,..,.))))))))))((..(((......)))..))((({{(.(((((...))))).)))))......))))))))))((((((((((((((((.{{{{{,{,,,.,||.,|||{((((........))))}{{({|.{|....}}...,},,.,,))})}},....))))))))))))))))....))))))....(((.,.((((..((.({...}).))..))))...))).{{{{,...}))}}.,|,|.|||,,,,..))),},...,)))))....)))))))))))))))))))))))))))))))).)))))..{,,{(({{,.{{{|||,.,,{(((({......)))))),,},,)))))).((((((((((..((.((((.((((((((........)).)))))).)))).))..,......((.((((((.(((.......))).)))))).))......,{{{{{(......{((({...,...)))},{{...(((((.((.....)))))))...}}}}}}},,........))))))))))........,{{{...,,,..|.|||,......,.,||||,|||{{{,|},......}}}}||,.,.,(((((...))))}...,,,,,}}.,,,}},,|||,}},.,,.)))},.}))},))),,......))))))).}..)))).))))))}..||....(((.((((({((((....}))),.))))))...)))..))))))))......,..,,,,,.(((((((((((.,,,((((({.((((((((((......{{{.((((((((.{((((((((({...(((({,.(((((...))))),.})))),|{{{{.({((,,.((((((((((((((((({({,,.(((({.......}))})|||||||{(((,((,{.((,{....,,||,|..}|.||||,,,|||}|{||{,..{{{,..,)))),,...,}||||...||,,,.,{..{(((({((....|{(({,....,,..||||||,|}}}})))}||},....}},,,.......}}}))))},}}))))))))}})))))}.,,||,|,,...{({{{{......,((({,(...(((((((.(((((..((((((.(((((((....((((.(((((.......)))))..)))).((((.(((((((...................((((((.((.........((.((((.((((((((......)))))))))))).)).}),))))))))))))))))).))))))).)))))).))))).))..)))))))))))))))),))),,}||||}}}))},...((((((((................(((..((((.((((((((.....(((((((.{{,...((((((((((,.......(((((.(((.....(((((..((..((((...((((..............))))...))))..))))))).))).)))))...{{{.{{{|,|{(({((((((((({(.((((.........)))).)),.(((({.{......}}}}}}...,{{{{{......}..||((,,{,(((((.(((,.......})}..)))}}}}),,,,}}((.(((((((({(,....}))))))))).)),,,,...((((({(........))).))))..(((.(((..((((((((..(((..({.{(...,|,,.{,..(((((..,((((........)))}.....{{(((((((((.{......))))))))).}}....))))),,..,.,,..)).))..)))...))))))))..)))...))).,,|{.(((((((.....((,...,))..))))))).)}{|((((.(((({(..(((((.((((..((((.........))))...)))))))))..)).)))))))),)}}..,,((((((.,........{((.,...})),......,..))))))})))))))}..,|}}}}}}})}))}..,)))))))))),},..((((((((((((.........)))))}(({...{(((.((((((((.........))),,))))...))))....})}.,.||{..{||.....}},.,}......)))))))))))))...)))))))).))))..))).)))))))}.,{|||{{|,,,))),}.}))))))}}))))).}.))))))))........,(({(........{{||||{{..{{{,..|||||{......,,.....}||{,...,....,,,{{...,,..((((((((((....))))))..))))...||}}},},..})}),,))))))))}))})),.,,..((((.((((((.......)))))).))))...,{{{{,{.(((((((....((...(((((((....((((...((((.....))))...)))),||,.(((........)))..((((((..({.(((..{((.........)}}..))).))......))))))....(((.(((,{((((.((((..(((((((.(((.((..(((((((.(((((.(((.,((((.((((..(((,(((((((((((.((((((((((.((.....,..(((((.,{....,,.)))))......))))))...)))))).)))))}))))))))).........((((.....))))...(((((...(((((((((((((..({.,((((((.((............)).)))))).(((((((........(((((((.,{..(((((((((..(((...((,....((((((((((((((.......))).)))),.}))))))(((((({(((......(((((....)))))((((....)))){{{{{.{((..(({......))}..)))}}}}}..)))))))))..((((.{.((((...))))}.)))).,,}}},......{,((({(.(((((....}}}}}.,.((((.(((((((((((.....((((.((((((((((......)).))))..)))).}))),((((...))))........,((((.((((.((((((((((((...,....,{({{{..,,......||(({(,.(((((.....))))),}}}},,{{{{{{{{.,{(,,.....|||{{{,,},,{((((({((((((({,(..(((((.....)))))..)))))|,|||{.{{{{({,..(((....))).(((((....))))).,,,{..{{{{......,,{(((,..,............,,,.{,,,.{{{{{{(({,,,..........}}}})))))..,{{{{,,||||.{({{,,.{{{{|||{|||||||.,.,}}},})}))|{||{||,,,,..)))))}}...,,},,.,,}}|||||{.,,{(((({{{{..,}}}}}.,{{{{....}}}}},}})),},},,|{{{|,,,,,,}},,,.,)})))})).))}||{{......(((((((.((.((((((....)).))))...)).))))))).,}|||(((((((((.(((((((.(((.({{.....}),))).)))).))).))))))))}....,||||}||}||||,.}}}))).))})}.,}},...}))))}..........)}))))))))))).)))).))))((((((.((...)}))))))...........{{{|.(((((((((((.......)))))))))))......(({...})).}))),))))))))))).))))...(((((((...)))))))|||||.........||||||||..,.,|((((,,,,,||||,||||||}}}|...(((.(((.....))).)))..,,......,,,,,,,,......,})))))))},..}||}}..,..}}..||||,||{{{{{,.,|||{.{{{...,))))))}))}..}}}}))})))..))))))))),}.))))))).(((((....)))))((.(((((......((......))......))))).))......(((((({...}))))))((({.(((((.((..(((((((..(((....))).))))))).)))))))...))))((({,(...(((((......)))))...)))))))))))).,))..))).)))))).....))))..))))))))).})))},))).))))))))))))..)).)))..)).)))))))))))))))))..))).)))))))..))...))))))),..|||,,,,||.,(({...{{{,.,,,..)))),.,..,,,.{((((((((...........)))))))).,....}})))..............,,,.....)))))))))),))))}))))))))))){{{{{{{|,....)))))})),,,..}}|||..|{{{{..(((((((((....)))))))))}}}))))).})}}.)))))).........................(((((((((((((((..,.{(({,...,,||}|....,|||((((({.{{..((((((((((((((...{((((({.{.{,,....}}}...}))))))......))}}}}))....)))))))..)).)))))),,},.....,,,..}))))))))))))))..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGCUGAUUCAUAGCCCCGGCCCGGGCCGCCUCUGCACGUCCGCCCCGGA… 1668 nt 0.4239
AGCUGAUUCAUAGCCCCGGCCCGGGCCGCCUCUGCACGUCCGCCCCGGA… 1929 nt 0.4650
AGCUGAUUCAUAGCCCCGGCCCGGGCCGCCUCUGCACGUCCGCCCCGGA… 5265 nt 0.4368
AGCUGAUUCAUAGCCCCGGCCCGGGCCGCCUCUGCACGUCCGCCCCGGA… 5268 nt 0.4370
AGCUGAUUCAUAGCCCCGGCCCGGGCCGCCUCUGCACGUCCGCCCCGGA… 5526 nt 0.4506
Summary

This gene encodes a member of the type I cytokine receptor family. The encoded protein heterodimerizes with interleukin 6 signal transducer to form the type II oncostatin M receptor and with interleukin 31 receptor A to form the interleukin 31 receptor, and thus transduces oncostatin M and interleukin 31 induced signaling events. Mutations in this gene have been associated with familial primary localized cutaneous amyloidosis. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2009]

Forensic Context

A study in mice and humans identified the OSMR as a novel disease gene for sepsis-induced myocardial dysfunction, showing it was up-regulated in LPS-induced mouse models and validated by qRT-PCR and external datasets [Yao et al. DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110911]. In a separate study, the OSMR was found to be up-regulated in the dorsal root ganglia of rats following UVB-induced inflammation, indicating its involvement in inflammatory pain responses [Dawes et al. DOI:10.1371/journal.pone.0093338].