Basic Information

Symbol
OSTF1
RNA class
mRNA
Alias
Osteoclast Stimulating Factor 1 BA235O14.1 SH3P2 OSF Osteoclast-Stimulating Factor 1
Location (GRCh38)
9:75088480-75149429
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012383.5
Sequence length
1348.0 nt
GC content
0.4214

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-379.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -404.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 370.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_012383.5 NCBI
ACUCGGCGGAGCCGCUCUGCCUGCGUCCGCUCUUCCCGCAGCCAAGGGU… 1348 nt 0.4214
Summary

Osteoclast-stimulating factor-1 is an intracellular protein produced by osteoclasts that indirectly induces osteoclast formation and bone resorption (Reddy et al., 1998 [PubMed 10092216]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

A study in human menstrual blood-derived stem cells (MenSCs) demonstrated that the gene encoding osteoclast-stimulating factor-1 (OSTF1) was up-regulated with increasing donor age, as identified through whole human genome microarray analysis [Chen et al. DOI:PMC4713568].