Basic Information

Symbol
OXSM
RNA class
mRNA
Alias
3-Oxoacyl-ACP Synthase, Mitochondrial FASN2D CEM1 KS 3-Oxoacyl-[Acyl-Carrier-Protein] Synthase, Mitochondrial Beta-Ketoacyl-ACP Synthase Beta-Ketoacyl Synthase EC 2.3.1.41 FLJ20604 Acyl-Malonyl Acyl Carrier Protein-Condensing Enzyme Type II Mitochondrial Beta-Ketoacyl Synthase 3-Ketoacyl-Acyl Carrier Protein Synthase 3-Oxoacyl-Acyl-Carrier-Protein Synthase EC 2.3.1 KASI
Location (GRCh38)
3:25782917-25796834
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017897.3
Sequence length
1506.0 nt
GC content
0.4449

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-466.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -494.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 290.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145391.2 NCBI
GCUCGAGAGCGUCAUCGCCCCCGACUGUGGAGAAGUGUCCGGGGUAGCC… 1257 nt 0.4375
NM_017897.3 NCBI
GCUCGAGAGCGUCAUCGCCCCCGACUGUGGAGAAGUGUCCGGGGUAGCC… 1506 nt 0.4449
Summary

This gene encodes a beta-ketoacyl synthetase. The encoded enzyme is required for elongation of fatty acid chains in the mitochondria. Alternatively spliced transcript variants have been described.[provided by RefSeq, Feb 2009]

Forensic Context

A study in mice, rats, monkeys, and human cells demonstrated that ionizing radiation significantly alters cutaneous fatty acid metabolism, with the gene Oxsm being upregulated in irradiated skin tissues [Tu et al. DOI:10.1016/j.jdermsci.2023.01.001]. This integrative multi-omic analysis identified Oxsm as a fatty acid-associated gene involved in fatty acid metabolism and biosynthesis pathways that are enriched following radiation exposure.