Basic Information

Symbol
OXTR
RNA class
mRNA
Alias
Oxytocin Receptor OTR OT-R
Location (GRCh38)
3:8750381-8769628
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000916.4
Sequence length
4387.0 nt
GC content
0.4990

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1504.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1581.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1147.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000916.4 NCBI
GUUAAGGCUCUGGGACCAACGCUGGGCGAACCAGCUCCGCUCCGGAGGG… 4387 nt 0.4990
NM_001354653.2 NCBI
GUUAAGGCUCUGGGACCAACGCUGGGCGAACCAGCUCCGCUCCGGAGGG… 4307 nt 0.4969
NM_001354654.2 NCBI
GUUAAGGCUCUGGGACCAACGCUGGGCGAACCAGCUCCGCUCCGGAGGG… 4364 nt 0.4979
NM_001354655.2 NCBI
AGGUAGCUGGGUGCUAAGCAGGGGUGGACGGGAUGGCUAGGGCCGGUGG… 4189 nt 0.4856
NM_001354656.3 NCBI
GUCCCGCGGCAGGUGGAUAUGCUGAGGGUCGGAGCCUGGGGCGAUGGAA… 4048 nt 0.4830
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the G-protein coupled receptor family and acts as a receptor for oxytocin. Its activity is mediated by G proteins which activate a phosphatidylinositol-calcium second messenger system. The oxytocin-oxytocin receptor system plays an important role in the uterus during parturition. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human postmortem dorsolateral prefrontal cortex demonstrated lower expression of the OXTR in both major depressive disorder and suicide, identified within a gene ontology set related to the regulation of glutamatergic synaptic transmission [Pantazatos et al. DOI:10.1038/mp.2016.130].