Basic Information

Symbol
ARPC5
RNA class
mRNA
Alias
Actin Related Protein 2/3 Complex Subunit 5 ARC16 DJ127C7.3 P16-Arc Actin-Related Protein 2/3 Complex Subunit 5 Arp2/3 Protein Complex Subunit P16 Arp2/3 Complex 16 KDa Subunit Actin Related Protein 2/3 Complex, Subunit 5 (16 KD) Actin Related Protein 2/3 Complex, Subunit 5, 16kDa Actin Related Protein 2/3 Complex Subunit 5, 16kDa P16-ARC IMD113
Location (GRCh38)
1:183620846-183635783
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005717.4
Sequence length
7266.0 nt
GC content
0.3955

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1936.64 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2081.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2103.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001270439.2 NCBI
AGUCGGCGACGCCUCAGAGCGGAAGAGGGAAGUGAAUCAGGCGCCGGGU… 7275 nt 0.3956
NM_005717.4 NCBI
AGUCGGCGACGCCUCAGAGCGGAAGAGGGAAGUGAAUCAGGCGCCGGGU… 7266 nt 0.3955
Summary

This gene encodes one of seven subunits of the human Arp2/3 protein complex. The Arp2/3 protein complex has been implicated in the control of actin polymerization in cells and has been conserved through evolution. The exact role of the protein encoded by this gene, the p16 subunit, has yet to be determined. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2012]

Forensic Context

A study in human postmortem cerebellar tissue demonstrated that the ARPC5 was analyzed via qRT-PCR as a candidate gene from a whole-genome microarray but was identified as an outlier in the regression correlation analysis [Schober et al. DOI:10.1007/s00414-014-1129-3].