Basic Information
Symbol
P2RY6
RNA class
mRNA
Alias
Pyrimidinergic Receptor P2Y6
P2Y6
Pyrimidinergic Receptor P2Y, G-Protein Coupled, 6
P2Y Purinoceptor 6
G-Coupled Nucleotide Receptor
P2 Purinoceptor
P2Y6 Receptor
Location (GRCh38)
11:73264498-73305103
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
Wound age identification
MANE select
Transcript ID
NM_001277204.2
Sequence length
2356.0 nt
GC content
0.5832
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-940.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-981.05 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
609.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGACUUCUGCCAGAACAUUGCACGCGACAGUUUCAGGCACAGAACUGAC… | 2356 nt | 0.5832 | |
| GCUCUGGCUCCUCUGGGUUCCAGGGACGCUGGGGCCGGAGCUGCUGCCG… | 2498 nt | 0.5901 | |
| CGGGAGGGCUUGGGAGAGUGAAAGCUCACCCGGAUCUGGGUGGAGAAAG… | 2463 nt | 0.5696 | |
| GCUCUGGCUCCUCUGGGUUCCAGGGACGCUGGGGCCGGAGCUGCUGCCG… | 2445 nt | 0.5906 | |
| GUUUGAGUGAGCAAACAGAGGGUGAAUGAAGUGACUUGCGGGCAGCUGG… | 2466 nt | 0.5815 | |
| GCUCUGGCUCCUCUGGGUUCCAGGGACGCUGGGGCCGGAGCUGCUGCCG… | 2531 nt | 0.5899 | |
| GCUCUGGCUCCUCUGGGUUCCAGGGACGCUGGGGCCGGAGCUGCUGCCG… | 2371 nt | 0.5917 | |
| AAGGACAGAGGAGGGGCCCUUCCUGUCAGCUGGCUGGGAGCAGAGGUGG… | 2649 nt | 0.5746 |
Summary
The product of this gene belongs to the family of P2 receptors, which is activated by extracellular nucleotides and subdivided into P2X ligand-gated ion channels and P2Y G-protein coupled receptors. This family has several receptor subtypes with different pharmacological selectivity, which overlaps in some cases, for various adenosine and uridine nucleotides. This receptor, which is a G-protein coupled receptor, is responsive to UDP, partially responsive to UTP and ADP, and not responsive to ATP. It is proposed that this receptor mediates inflammatory responses. Alternative splicing results in multiple transcript variants that encode different protein isoforms. [provided by RefSeq, Mar 2013]
Forensic Context
A study in mice demonstrated that the gene P2RY6, a microglial marker, was upregulated in a specific spatial cluster (cluster 13) identified as an injury hotspot at 7 days post-traumatic brain injury [Kounelis-Wuillaume et al. DOI:10.1177/08977151251390528].