Basic Information

Symbol
P4HA1
RNA class
mRNA
Alias
Prolyl 4-Hydroxylase Subunit Alpha 1 C-P4Halpha(I) P4HA Procollagen-Proline, 2-Oxoglutarate 4-Dioxygenase (Proline 4-Hydroxylase), Alpha Polypeptide I Procollagen-Proline,2-Oxoglutarate-4-Dioxygenase Subunit Alpha-1 Prolyl 4-Hydroxylase, Alpha Polypeptide I Collagen Prolyl 4-Hydroxylase Alpha(I) Prolyl 4-Hydroxylase Subunit Alpha-1 EC 1.14.11.2 4-PH Alpha-1
Location (GRCh38)
10:73005811-73096983
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001017962.3
Sequence length
2743.0 nt
GC content
0.3974

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-737.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -793.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 678.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000917.4 NCBI
GCCCAGUCGCGCCGCCAGCGGGCUGAGGGUAGGAAGUAGCCGCUCCGAG… 2743 nt 0.3981
NM_001017962.3 NCBI
GCCCAGUCGCGCCGCCAGCGGGCUGAGGGUAGGAAGUAGCCGCUCCGAG… 2743 nt 0.3974
NM_001142595.2 NCBI
GCCCAGUCGCGCCGCCAGCGGGCUGAGGGUAGGAAGUAGCCGCUCCGAG… 2836 nt 0.4009
NM_001142596.2 NCBI
GCCCAGUCGCGCCGCCAGCGGGCUGAGGGUAGGAAGUAGCCGCUCCGAG… 2689 nt 0.3972
Summary

This gene encodes a component of prolyl 4-hydroxylase, a key enzyme in collagen synthesis composed of two identical alpha subunits and two beta subunits. The encoded protein is one of several different types of alpha subunits and provides the major part of the catalytic site of the active enzyme. In collagen and related proteins, prolyl 4-hydroxylase catalyzes the formation of 4-hydroxyproline that is essential to the proper three-dimensional folding of newly synthesized procollagen chains. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.