Basic Information

Symbol
PABPC4L
RNA class
mRNA
Alias
Poly(A) Binding Protein Cytoplasmic 4 Like Polyadenylate-Binding Protein 4-Like PABP-4-Like Poly(A) Binding Protein, Cytoplasmic 4-Like Poly(A)-Binding Protein 4-Like
Location (GRCh38)
4:134196333-134201885
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001114734.2
Sequence length
4985.0 nt
GC content
0.3356

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1179.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1285.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1302.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001114734.2 NCBI
ACUUGGCAGCGAGUGCGCGGGAAGUUCAGCGCGCGAGUUCCGGGCUUCC… 4985 nt 0.3356
NM_001363585.1 NCBI
ACUUGGCAGCGAGUGCGCGGGAAGUUCAGCGCGCGAGUUCCGGGCUUCC… 5040 nt 0.3407
Summary

Predicted to enable mRNA 3'-UTR binding activity; poly(A) binding activity; and poly(U) RNA binding activity. Predicted to be part of ribonucleoprotein complex. Predicted to be active in cytoplasmic stress granule; cytosol; and nucleus. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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