Basic Information

Symbol
PACRG
RNA class
mRNA
Alias
Parkin Coregulated HAK005771 PARK2CRG BUG21 Glup Pf12 Molecular Chaperone/Chaperonin-Binding Protein Parkin Coregulated Gene Protein PARK2 Coregulated FLJ32724 Parkin Co-Regulated Gene Protein PARK2 Coregulated Gene Protein PARK2 Co-Regulated PACRG2.1 GLUP
Location (GRCh38)
6:162727132-163315500
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001080379.2
Sequence length
1549.0 nt
GC content
0.4668

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-469.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -498.52 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 366.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001080378.2 NCBI
AGAUCUAUCUGGAGGAGUUUCUGUGGAGCCAGCCACCCUCACCAGGUGC… 1511 nt 0.4659
NM_001080379.2 NCBI
GCUUAGCAACCGGGAGGCUUACCUUUGGAAGCUUGUUGCAGCUCUAGCC… 1549 nt 0.4668
NM_152410.3 NCBI
AGAUCUAUCUGGAGGAGUUUCUGUGGAGCCAGCCACCCUCACCAGGUGC… 1628 nt 0.4730
Summary

This gene encodes a protein that is conserved across metazoans. In vertebrates, this gene is linked in a head-to-head arrangement with the adjacent parkin gene, which is associated with autosomal recessive juvenile Parkinson's disease. These genes are co-regulated in various tissues and they share a bi-directional promoter. Both genes are associated with susceptibility to leprosy. The parkin co-regulated gene protein forms a large molecular complex with chaperones, including heat shock proteins 70 and 90, and chaperonin components. This protein is also a component of Lewy bodies in Parkinson's disease patients, and it suppresses unfolded Pael receptor-induced neuronal cell death. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the PACRG (Pacrg) was downregulated in oligodendrocytes in a post-mortem interval (PMI)-dependent manner, with its decreased expression associated with increased cellular perturbations [Guo et al. DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147708]. The experimental findings indicated that increased levels of the PACRG confer resistance to aggresome disruption and cell death, establishing its role as a cell death regulation gene in the context of post-mortem brain ischemia.