Basic Information

Symbol
PACS2
RNA class
mRNA
Alias
Phosphofurin Acidic Cluster Sorting Protein 2 KIAA0602 PACS1L PACS1-Like Protein PACS-2 Phosphofurin Acidic Cluster Sorting Protein 1-Like EIEE66 DEE66
Location (GRCh38)
14:105300563-105398147
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001100913.3
Sequence length
6361.0 nt
GC content
0.6152

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2754.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2858.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1367.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001100913.3 NCBI
GCAGCUCGUCGCCGCCCGCGGGCCUGUCCGACGCCGGGGCCCGGCCCGU… 6361 nt 0.6152
NM_001243127.3 NCBI
GCAGAUUCGCCGCGCGCGCCCGGGCCGCGCCGCCCGCAACGGCCGCGCC… 6208 nt 0.6131
NM_015197.4 NCBI
GCAGCUCGUCGCCGCCCGCGGGCCUGUCCGACGCCGGGGCCCGGCCCGU… 6316 nt 0.6167
Summary

Predicted to enable transmembrane transporter binding activity. Involved in endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis; mitochondrion-endoplasmic reticulum membrane tethering; and protein localization to plasma membrane. Acts upstream of or within protein localization to phagophore assembly site. Located in endoplasmic reticulum and mitochondrion. Implicated in developmental and epileptic encephalopathy 66. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A systematic review of preclinical studies in rats and mice demonstrated that the PACS2 shows increased expression of more than 50% in the presence of endothelial damage in animal models of erectile dysfunction [Gómez-Bueno et al. DOI:10.1007/s11255-025-04895-3].