Basic Information

Symbol
PADI3
RNA class
mRNA
Alias
Peptidyl Arginine Deiminase 3 PDI3 Peptidyl Arginine Deiminase, Type III Protein-Arginine Deiminase Type III Protein-Arginine Deiminase Type-3 Peptidylarginine Deiminase III EC 3.5.3.15 PAD3 UHS1
Location (GRCh38)
1:17249098-17284233
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016233.2
Sequence length
3189.0 nt
GC content
0.5604

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1251.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1309.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1120.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_016233.2 NCBI
AGUGUUGGGGUUGGCGGCCACAGCUAAGUCCAACACCAGCAUGUCGCUG… 3189 nt 0.5604
Summary

This gene encodes a member of the peptidyl arginine deiminase family of enzymes, which catalyze the post-translational deimination of proteins by converting arginine residues into citrullines in the presence of calcium ions. The family members have distinct substrate specificities and tissue-specific expression patterns. The type III enzyme modulates hair structural proteins, such as filaggrin in the hair follicle and trichohyalin in the inner root sheath, during hair follicle formation. Together with the type I enzyme, this enzyme may also play a role in terminal differentiation of the epidermis. This gene exists in a cluster with four other paralogous genes. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.